Protein–RNA interactions for Protein: O95237

LRAT, Lecithin retinol acyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRATO95237 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LRATO95237 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LRATO95237 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LRATO95237 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LRATO95237 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LRATO95237 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LRATO95237 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LRATO95237 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
LRATO95237 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LRATO95237 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LRATO95237 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
LRATO95237 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LRATO95237 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LRATO95237 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LRATO95237 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LRATO95237 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LRATO95237 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LRATO95237 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LRATO95237 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LRATO95237 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LRATO95237 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LRATO95237 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LRATO95237 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LRATO95237 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LRATO95237 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LRATO95237 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LRATO95237 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LRATO95237 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LRATO95237 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
LRATO95237 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LRATO95237 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LRATO95237 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LRATO95237 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LRATO95237 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LRATO95237 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LRATO95237 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LRATO95237 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LRATO95237 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LRATO95237 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LRATO95237 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LRATO95237 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LRATO95237 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LRATO95237 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
LRATO95237 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LRATO95237 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LRATO95237 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LRATO95237 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LRATO95237 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LRATO95237 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LRATO95237 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
LRATO95237 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LRATO95237 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LRATO95237 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LRATO95237 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LRATO95237 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LRATO95237 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LRATO95237 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LRATO95237 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LRATO95237 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LRATO95237 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LRATO95237 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LRATO95237 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LRATO95237 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LRATO95237 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
LRATO95237 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LRATO95237 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LRATO95237 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LRATO95237 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LRATO95237 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LRATO95237 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LRATO95237 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LRATO95237 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LRATO95237 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LRATO95237 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LRATO95237 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LRATO95237 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LRATO95237 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LRATO95237 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LRATO95237 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LRATO95237 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LRATO95237 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LRATO95237 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LRATO95237 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LRATO95237 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LRATO95237 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LRATO95237 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LRATO95237 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
LRATO95237 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LRATO95237 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LRATO95237 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LRATO95237 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LRATO95237 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LRATO95237 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LRATO95237 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LRATO95237 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LRATO95237 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LRATO95237 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LRATO95237 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LRATO95237 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LRATO95237 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms