Protein–RNA interactions for Protein: O60486

PLXNC1, Plexin-C1, humanhuman

Predictions only

Length 1,568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXNC1O60486 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
PLXNC1O60486 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
PLXNC1O60486 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PLXNC1O60486 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PLXNC1O60486 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PLXNC1O60486 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PLXNC1O60486 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PLXNC1O60486 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PLXNC1O60486 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PLXNC1O60486 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PLXNC1O60486 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PLXNC1O60486 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PLXNC1O60486 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PLXNC1O60486 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PLXNC1O60486 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PLXNC1O60486 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PLXNC1O60486 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PLXNC1O60486 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
PLXNC1O60486 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PLXNC1O60486 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PLXNC1O60486 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PLXNC1O60486 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PLXNC1O60486 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PLXNC1O60486 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PLXNC1O60486 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PLXNC1O60486 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PLXNC1O60486 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PLXNC1O60486 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
PLXNC1O60486 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PLXNC1O60486 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PLXNC1O60486 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PLXNC1O60486 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PLXNC1O60486 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PLXNC1O60486 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PLXNC1O60486 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PLXNC1O60486 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PLXNC1O60486 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PLXNC1O60486 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PLXNC1O60486 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PLXNC1O60486 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PLXNC1O60486 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PLXNC1O60486 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PLXNC1O60486 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PLXNC1O60486 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PLXNC1O60486 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PLXNC1O60486 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PLXNC1O60486 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
PLXNC1O60486 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PLXNC1O60486 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PLXNC1O60486 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PLXNC1O60486 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PLXNC1O60486 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PLXNC1O60486 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PLXNC1O60486 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PLXNC1O60486 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PLXNC1O60486 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PLXNC1O60486 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PLXNC1O60486 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PLXNC1O60486 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PLXNC1O60486 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PLXNC1O60486 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PLXNC1O60486 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PLXNC1O60486 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PLXNC1O60486 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PLXNC1O60486 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PLXNC1O60486 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PLXNC1O60486 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PLXNC1O60486 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PLXNC1O60486 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PLXNC1O60486 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PLXNC1O60486 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PLXNC1O60486 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PLXNC1O60486 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PLXNC1O60486 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
PLXNC1O60486 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
PLXNC1O60486 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
PLXNC1O60486 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PLXNC1O60486 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PLXNC1O60486 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PLXNC1O60486 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PLXNC1O60486 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PLXNC1O60486 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PLXNC1O60486 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PLXNC1O60486 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PLXNC1O60486 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PLXNC1O60486 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PLXNC1O60486 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PLXNC1O60486 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
PLXNC1O60486 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
PLXNC1O60486 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
PLXNC1O60486 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PLXNC1O60486 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PLXNC1O60486 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PLXNC1O60486 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PLXNC1O60486 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PLXNC1O60486 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PLXNC1O60486 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PLXNC1O60486 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PLXNC1O60486 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PLXNC1O60486 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms