Protein–RNA interactions for Protein: O43567

RNF13, E3 ubiquitin-protein ligase RNF13, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF13O43567 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RNF13O43567 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RNF13O43567 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RNF13O43567 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RNF13O43567 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
RNF13O43567 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
RNF13O43567 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
RNF13O43567 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RNF13O43567 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RNF13O43567 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RNF13O43567 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RNF13O43567 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RNF13O43567 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RNF13O43567 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RNF13O43567 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RNF13O43567 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RNF13O43567 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RNF13O43567 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RNF13O43567 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RNF13O43567 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RNF13O43567 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RNF13O43567 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RNF13O43567 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RNF13O43567 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RNF13O43567 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RNF13O43567 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RNF13O43567 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RNF13O43567 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RNF13O43567 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RNF13O43567 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RNF13O43567 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RNF13O43567 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RNF13O43567 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RNF13O43567 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RNF13O43567 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RNF13O43567 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RNF13O43567 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RNF13O43567 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RNF13O43567 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RNF13O43567 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RNF13O43567 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RNF13O43567 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RNF13O43567 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RNF13O43567 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RNF13O43567 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RNF13O43567 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RNF13O43567 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
RNF13O43567 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RNF13O43567 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RNF13O43567 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
RNF13O43567 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RNF13O43567 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RNF13O43567 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RNF13O43567 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RNF13O43567 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RNF13O43567 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RNF13O43567 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RNF13O43567 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RNF13O43567 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RNF13O43567 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RNF13O43567 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RNF13O43567 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RNF13O43567 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RNF13O43567 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RNF13O43567 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RNF13O43567 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RNF13O43567 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RNF13O43567 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RNF13O43567 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RNF13O43567 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RNF13O43567 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RNF13O43567 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RNF13O43567 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RNF13O43567 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RNF13O43567 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RNF13O43567 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RNF13O43567 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RNF13O43567 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RNF13O43567 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RNF13O43567 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RNF13O43567 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RNF13O43567 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RNF13O43567 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RNF13O43567 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RNF13O43567 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RNF13O43567 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RNF13O43567 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RNF13O43567 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RNF13O43567 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RNF13O43567 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RNF13O43567 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RNF13O43567 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RNF13O43567 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RNF13O43567 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
RNF13O43567 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RNF13O43567 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RNF13O43567 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RNF13O43567 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RNF13O43567 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RNF13O43567 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms