Protein–RNA interactions for Protein: O43557

TNFSF14, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 14, humanhuman

Predictions only

Length 240 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF14O43557 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TNFSF14O43557 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TNFSF14O43557 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TNFSF14O43557 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TNFSF14O43557 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TNFSF14O43557 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TNFSF14O43557 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TNFSF14O43557 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TNFSF14O43557 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TNFSF14O43557 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TNFSF14O43557 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TNFSF14O43557 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TNFSF14O43557 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TNFSF14O43557 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TNFSF14O43557 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
TNFSF14O43557 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TNFSF14O43557 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
TNFSF14O43557 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TNFSF14O43557 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TNFSF14O43557 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TNFSF14O43557 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TNFSF14O43557 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TNFSF14O43557 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TNFSF14O43557 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TNFSF14O43557 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TNFSF14O43557 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TNFSF14O43557 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TNFSF14O43557 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TNFSF14O43557 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TNFSF14O43557 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TNFSF14O43557 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TNFSF14O43557 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TNFSF14O43557 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TNFSF14O43557 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TNFSF14O43557 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TNFSF14O43557 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TNFSF14O43557 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TNFSF14O43557 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TNFSF14O43557 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TNFSF14O43557 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TNFSF14O43557 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TNFSF14O43557 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TNFSF14O43557 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TNFSF14O43557 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TNFSF14O43557 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TNFSF14O43557 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TNFSF14O43557 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TNFSF14O43557 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
TNFSF14O43557 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TNFSF14O43557 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
TNFSF14O43557 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TNFSF14O43557 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
TNFSF14O43557 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TNFSF14O43557 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TNFSF14O43557 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TNFSF14O43557 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TNFSF14O43557 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TNFSF14O43557 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TNFSF14O43557 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TNFSF14O43557 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TNFSF14O43557 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TNFSF14O43557 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TNFSF14O43557 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TNFSF14O43557 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TNFSF14O43557 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TNFSF14O43557 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TNFSF14O43557 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TNFSF14O43557 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TNFSF14O43557 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TNFSF14O43557 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TNFSF14O43557 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TNFSF14O43557 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TNFSF14O43557 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TNFSF14O43557 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TNFSF14O43557 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TNFSF14O43557 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TNFSF14O43557 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TNFSF14O43557 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
TNFSF14O43557 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TNFSF14O43557 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TNFSF14O43557 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TNFSF14O43557 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TNFSF14O43557 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TNFSF14O43557 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TNFSF14O43557 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TNFSF14O43557 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TNFSF14O43557 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TNFSF14O43557 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
TNFSF14O43557 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
TNFSF14O43557 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TNFSF14O43557 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TNFSF14O43557 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TNFSF14O43557 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TNFSF14O43557 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TNFSF14O43557 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TNFSF14O43557 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
TNFSF14O43557 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TNFSF14O43557 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TNFSF14O43557 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
TNFSF14O43557 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms