Protein–RNA interactions for Protein: O43364

HOXA2, Homeobox protein Hox-A2, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA2O43364 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXA2O43364 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXA2O43364 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXA2O43364 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXA2O43364 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXA2O43364 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXA2O43364 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXA2O43364 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXA2O43364 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXA2O43364 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXA2O43364 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXA2O43364 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXA2O43364 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXA2O43364 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXA2O43364 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXA2O43364 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXA2O43364 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXA2O43364 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXA2O43364 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXA2O43364 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXA2O43364 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXA2O43364 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXA2O43364 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXA2O43364 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXA2O43364 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXA2O43364 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXA2O43364 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXA2O43364 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXA2O43364 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXA2O43364 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXA2O43364 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXA2O43364 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXA2O43364 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXA2O43364 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXA2O43364 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXA2O43364 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXA2O43364 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXA2O43364 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXA2O43364 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXA2O43364 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXA2O43364 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXA2O43364 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXA2O43364 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXA2O43364 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXA2O43364 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXA2O43364 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXA2O43364 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXA2O43364 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXA2O43364 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXA2O43364 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXA2O43364 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXA2O43364 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXA2O43364 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXA2O43364 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXA2O43364 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXA2O43364 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXA2O43364 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXA2O43364 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXA2O43364 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXA2O43364 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXA2O43364 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXA2O43364 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXA2O43364 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXA2O43364 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXA2O43364 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXA2O43364 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXA2O43364 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXA2O43364 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXA2O43364 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXA2O43364 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXA2O43364 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXA2O43364 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXA2O43364 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXA2O43364 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXA2O43364 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXA2O43364 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXA2O43364 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXA2O43364 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXA2O43364 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXA2O43364 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXA2O43364 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXA2O43364 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXA2O43364 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXA2O43364 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXA2O43364 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXA2O43364 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXA2O43364 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXA2O43364 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXA2O43364 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXA2O43364 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXA2O43364 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXA2O43364 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXA2O43364 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXA2O43364 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXA2O43364 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXA2O43364 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXA2O43364 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXA2O43364 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXA2O43364 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXA2O43364 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms