Protein–RNA interactions for Protein: E9PRG8

C11orf98, Uncharacterized protein C11orf98, humanhuman

Predictions only

Length 122 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C11orf98E9PRG8 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C11orf98E9PRG8 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C11orf98E9PRG8 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C11orf98E9PRG8 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C11orf98E9PRG8 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C11orf98E9PRG8 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C11orf98E9PRG8 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C11orf98E9PRG8 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C11orf98E9PRG8 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C11orf98E9PRG8 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C11orf98E9PRG8 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C11orf98E9PRG8 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C11orf98E9PRG8 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
C11orf98E9PRG8 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C11orf98E9PRG8 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C11orf98E9PRG8 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C11orf98E9PRG8 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C11orf98E9PRG8 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C11orf98E9PRG8 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
C11orf98E9PRG8 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C11orf98E9PRG8 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C11orf98E9PRG8 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C11orf98E9PRG8 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C11orf98E9PRG8 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C11orf98E9PRG8 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C11orf98E9PRG8 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C11orf98E9PRG8 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C11orf98E9PRG8 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C11orf98E9PRG8 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C11orf98E9PRG8 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C11orf98E9PRG8 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C11orf98E9PRG8 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C11orf98E9PRG8 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C11orf98E9PRG8 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C11orf98E9PRG8 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C11orf98E9PRG8 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C11orf98E9PRG8 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C11orf98E9PRG8 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C11orf98E9PRG8 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C11orf98E9PRG8 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C11orf98E9PRG8 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C11orf98E9PRG8 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C11orf98E9PRG8 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C11orf98E9PRG8 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
C11orf98E9PRG8 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C11orf98E9PRG8 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C11orf98E9PRG8 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C11orf98E9PRG8 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C11orf98E9PRG8 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C11orf98E9PRG8 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C11orf98E9PRG8 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C11orf98E9PRG8 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C11orf98E9PRG8 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C11orf98E9PRG8 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C11orf98E9PRG8 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C11orf98E9PRG8 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C11orf98E9PRG8 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C11orf98E9PRG8 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C11orf98E9PRG8 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C11orf98E9PRG8 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C11orf98E9PRG8 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C11orf98E9PRG8 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C11orf98E9PRG8 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C11orf98E9PRG8 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C11orf98E9PRG8 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C11orf98E9PRG8 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
C11orf98E9PRG8 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C11orf98E9PRG8 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C11orf98E9PRG8 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C11orf98E9PRG8 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C11orf98E9PRG8 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C11orf98E9PRG8 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C11orf98E9PRG8 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C11orf98E9PRG8 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C11orf98E9PRG8 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C11orf98E9PRG8 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C11orf98E9PRG8 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C11orf98E9PRG8 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C11orf98E9PRG8 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C11orf98E9PRG8 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C11orf98E9PRG8 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C11orf98E9PRG8 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C11orf98E9PRG8 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
C11orf98E9PRG8 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C11orf98E9PRG8 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C11orf98E9PRG8 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C11orf98E9PRG8 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C11orf98E9PRG8 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
C11orf98E9PRG8 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C11orf98E9PRG8 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
C11orf98E9PRG8 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C11orf98E9PRG8 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C11orf98E9PRG8 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C11orf98E9PRG8 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
C11orf98E9PRG8 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C11orf98E9PRG8 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C11orf98E9PRG8 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C11orf98E9PRG8 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C11orf98E9PRG8 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C11orf98E9PRG8 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms