Protein–RNA interactions for Protein: A6NGW2

STRCP1, Putative stereocilin-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRCP1A6NGW2 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
STRCP1A6NGW2 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
STRCP1A6NGW2 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
STRCP1A6NGW2 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
STRCP1A6NGW2 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
STRCP1A6NGW2 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
STRCP1A6NGW2 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
STRCP1A6NGW2 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
STRCP1A6NGW2 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
STRCP1A6NGW2 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
STRCP1A6NGW2 OSM-202ENST00000403389 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
STRCP1A6NGW2 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
STRCP1A6NGW2 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
STRCP1A6NGW2 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
STRCP1A6NGW2 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
STRCP1A6NGW2 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
STRCP1A6NGW2 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
STRCP1A6NGW2 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
STRCP1A6NGW2 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
STRCP1A6NGW2 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
STRCP1A6NGW2 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
STRCP1A6NGW2 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
STRCP1A6NGW2 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
STRCP1A6NGW2 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
STRCP1A6NGW2 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
STRCP1A6NGW2 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
STRCP1A6NGW2 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
STRCP1A6NGW2 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
STRCP1A6NGW2 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
STRCP1A6NGW2 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
STRCP1A6NGW2 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
STRCP1A6NGW2 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
STRCP1A6NGW2 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
STRCP1A6NGW2 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
STRCP1A6NGW2 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
STRCP1A6NGW2 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
STRCP1A6NGW2 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
STRCP1A6NGW2 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
STRCP1A6NGW2 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
STRCP1A6NGW2 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
STRCP1A6NGW2 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
STRCP1A6NGW2 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
STRCP1A6NGW2 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
STRCP1A6NGW2 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
STRCP1A6NGW2 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
STRCP1A6NGW2 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
STRCP1A6NGW2 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
STRCP1A6NGW2 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
STRCP1A6NGW2 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
STRCP1A6NGW2 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
STRCP1A6NGW2 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
STRCP1A6NGW2 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
STRCP1A6NGW2 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
STRCP1A6NGW2 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
STRCP1A6NGW2 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
STRCP1A6NGW2 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
STRCP1A6NGW2 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
STRCP1A6NGW2 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
STRCP1A6NGW2 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
STRCP1A6NGW2 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
STRCP1A6NGW2 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
STRCP1A6NGW2 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
STRCP1A6NGW2 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
STRCP1A6NGW2 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
STRCP1A6NGW2 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
STRCP1A6NGW2 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
STRCP1A6NGW2 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
STRCP1A6NGW2 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
STRCP1A6NGW2 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
STRCP1A6NGW2 AC100858.3-202ENST00000533496 553 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
STRCP1A6NGW2 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
STRCP1A6NGW2 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
STRCP1A6NGW2 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
STRCP1A6NGW2 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
STRCP1A6NGW2 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
STRCP1A6NGW2 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
STRCP1A6NGW2 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
STRCP1A6NGW2 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
STRCP1A6NGW2 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
STRCP1A6NGW2 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
STRCP1A6NGW2 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
STRCP1A6NGW2 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
STRCP1A6NGW2 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
STRCP1A6NGW2 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
STRCP1A6NGW2 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
STRCP1A6NGW2 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
STRCP1A6NGW2 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
STRCP1A6NGW2 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
STRCP1A6NGW2 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
STRCP1A6NGW2 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
STRCP1A6NGW2 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
STRCP1A6NGW2 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
STRCP1A6NGW2 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
STRCP1A6NGW2 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
STRCP1A6NGW2 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
STRCP1A6NGW2 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
STRCP1A6NGW2 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
STRCP1A6NGW2 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
STRCP1A6NGW2 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
STRCP1A6NGW2 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms