Protein–RNA interactions for Protein: A2VCL2

CCDC162P, Coiled-coil domain-containing protein 162, humanhuman

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC162PA2VCL2 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC162PA2VCL2 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC162PA2VCL2 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC162PA2VCL2 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC162PA2VCL2 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC162PA2VCL2 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC162PA2VCL2 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC162PA2VCL2 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CCDC162PA2VCL2 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CCDC162PA2VCL2 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CCDC162PA2VCL2 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CCDC162PA2VCL2 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CCDC162PA2VCL2 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CCDC162PA2VCL2 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CCDC162PA2VCL2 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CCDC162PA2VCL2 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CCDC162PA2VCL2 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CCDC162PA2VCL2 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CCDC162PA2VCL2 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC162PA2VCL2 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC162PA2VCL2 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC162PA2VCL2 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC162PA2VCL2 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC162PA2VCL2 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC162PA2VCL2 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC162PA2VCL2 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC162PA2VCL2 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC162PA2VCL2 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC162PA2VCL2 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC162PA2VCL2 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC162PA2VCL2 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC162PA2VCL2 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC162PA2VCL2 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC162PA2VCL2 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC162PA2VCL2 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC162PA2VCL2 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC162PA2VCL2 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC162PA2VCL2 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC162PA2VCL2 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC162PA2VCL2 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC162PA2VCL2 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC162PA2VCL2 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC162PA2VCL2 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC162PA2VCL2 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC162PA2VCL2 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC162PA2VCL2 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC162PA2VCL2 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC162PA2VCL2 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC162PA2VCL2 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC162PA2VCL2 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC162PA2VCL2 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC162PA2VCL2 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC162PA2VCL2 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC162PA2VCL2 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC162PA2VCL2 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC162PA2VCL2 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC162PA2VCL2 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC162PA2VCL2 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC162PA2VCL2 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC162PA2VCL2 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC162PA2VCL2 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC162PA2VCL2 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC162PA2VCL2 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC162PA2VCL2 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC162PA2VCL2 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC162PA2VCL2 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC162PA2VCL2 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC162PA2VCL2 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC162PA2VCL2 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC162PA2VCL2 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC162PA2VCL2 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC162PA2VCL2 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC162PA2VCL2 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC162PA2VCL2 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC162PA2VCL2 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC162PA2VCL2 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC162PA2VCL2 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC162PA2VCL2 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC162PA2VCL2 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC162PA2VCL2 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC162PA2VCL2 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC162PA2VCL2 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC162PA2VCL2 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC162PA2VCL2 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC162PA2VCL2 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC162PA2VCL2 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC162PA2VCL2 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC162PA2VCL2 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC162PA2VCL2 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC162PA2VCL2 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC162PA2VCL2 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC162PA2VCL2 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC162PA2VCL2 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC162PA2VCL2 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC162PA2VCL2 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC162PA2VCL2 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC162PA2VCL2 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC162PA2VCL2 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC162PA2VCL2 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC162PA2VCL2 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms