Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2Q0

ATP8A1, Phospholipid-transporting ATPase IA, humanhuman

Predictions only

Length 1,164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP8A1Q9Y2Q0 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATP8A1Q9Y2Q0 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATP8A1Q9Y2Q0 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATP8A1Q9Y2Q0 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATP8A1Q9Y2Q0 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATP8A1Q9Y2Q0 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATP8A1Q9Y2Q0 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATP8A1Q9Y2Q0 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATP8A1Q9Y2Q0 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATP8A1Q9Y2Q0 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATP8A1Q9Y2Q0 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATP8A1Q9Y2Q0 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATP8A1Q9Y2Q0 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATP8A1Q9Y2Q0 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATP8A1Q9Y2Q0 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATP8A1Q9Y2Q0 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATP8A1Q9Y2Q0 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATP8A1Q9Y2Q0 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATP8A1Q9Y2Q0 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATP8A1Q9Y2Q0 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATP8A1Q9Y2Q0 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATP8A1Q9Y2Q0 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATP8A1Q9Y2Q0 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATP8A1Q9Y2Q0 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
ATP8A1Q9Y2Q0 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ATP8A1Q9Y2Q0 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ATP8A1Q9Y2Q0 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ATP8A1Q9Y2Q0 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ATP8A1Q9Y2Q0 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ATP8A1Q9Y2Q0 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ATP8A1Q9Y2Q0 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATP8A1Q9Y2Q0 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATP8A1Q9Y2Q0 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATP8A1Q9Y2Q0 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATP8A1Q9Y2Q0 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATP8A1Q9Y2Q0 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ATP8A1Q9Y2Q0 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATP8A1Q9Y2Q0 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATP8A1Q9Y2Q0 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATP8A1Q9Y2Q0 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATP8A1Q9Y2Q0 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATP8A1Q9Y2Q0 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATP8A1Q9Y2Q0 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATP8A1Q9Y2Q0 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ATP8A1Q9Y2Q0 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATP8A1Q9Y2Q0 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATP8A1Q9Y2Q0 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATP8A1Q9Y2Q0 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATP8A1Q9Y2Q0 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATP8A1Q9Y2Q0 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATP8A1Q9Y2Q0 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATP8A1Q9Y2Q0 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATP8A1Q9Y2Q0 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATP8A1Q9Y2Q0 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATP8A1Q9Y2Q0 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATP8A1Q9Y2Q0 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATP8A1Q9Y2Q0 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATP8A1Q9Y2Q0 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATP8A1Q9Y2Q0 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATP8A1Q9Y2Q0 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATP8A1Q9Y2Q0 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATP8A1Q9Y2Q0 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATP8A1Q9Y2Q0 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATP8A1Q9Y2Q0 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATP8A1Q9Y2Q0 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATP8A1Q9Y2Q0 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ATP8A1Q9Y2Q0 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC18■□□□□ 0.47
ATP8A1Q9Y2Q0 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ATP8A1Q9Y2Q0 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATP8A1Q9Y2Q0 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ATP8A1Q9Y2Q0 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATP8A1Q9Y2Q0 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ATP8A1Q9Y2Q0 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ATP8A1Q9Y2Q0 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
ATP8A1Q9Y2Q0 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ATP8A1Q9Y2Q0 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ATP8A1Q9Y2Q0 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ATP8A1Q9Y2Q0 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATP8A1Q9Y2Q0 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
ATP8A1Q9Y2Q0 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC18■□□□□ 0.47
ATP8A1Q9Y2Q0 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC18■□□□□ 0.47
ATP8A1Q9Y2Q0 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
ATP8A1Q9Y2Q0 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC18■□□□□ 0.47
ATP8A1Q9Y2Q0 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ATP8A1Q9Y2Q0 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC18■□□□□ 0.47
ATP8A1Q9Y2Q0 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ATP8A1Q9Y2Q0 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ATP8A1Q9Y2Q0 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATP8A1Q9Y2Q0 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC18■□□□□ 0.47
ATP8A1Q9Y2Q0 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATP8A1Q9Y2Q0 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ATP8A1Q9Y2Q0 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATP8A1Q9Y2Q0 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
ATP8A1Q9Y2Q0 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATP8A1Q9Y2Q0 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ATP8A1Q9Y2Q0 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ATP8A1Q9Y2Q0 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ATP8A1Q9Y2Q0 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ATP8A1Q9Y2Q0 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP8A1Q9Y2Q0 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms