Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y285

FARSA, Phenylalanine--tRNA ligase alpha subunit, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FARSAQ9Y285 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FARSAQ9Y285 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FARSAQ9Y285 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FARSAQ9Y285 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FARSAQ9Y285 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FARSAQ9Y285 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FARSAQ9Y285 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FARSAQ9Y285 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FARSAQ9Y285 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FARSAQ9Y285 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FARSAQ9Y285 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FARSAQ9Y285 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FARSAQ9Y285 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FARSAQ9Y285 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FARSAQ9Y285 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FARSAQ9Y285 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FARSAQ9Y285 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
FARSAQ9Y285 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FARSAQ9Y285 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FARSAQ9Y285 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FARSAQ9Y285 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FARSAQ9Y285 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FARSAQ9Y285 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FARSAQ9Y285 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FARSAQ9Y285 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FARSAQ9Y285 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FARSAQ9Y285 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FARSAQ9Y285 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FARSAQ9Y285 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FARSAQ9Y285 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FARSAQ9Y285 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FARSAQ9Y285 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FARSAQ9Y285 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FARSAQ9Y285 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FARSAQ9Y285 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FARSAQ9Y285 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FARSAQ9Y285 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FARSAQ9Y285 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FARSAQ9Y285 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FARSAQ9Y285 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FARSAQ9Y285 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FARSAQ9Y285 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FARSAQ9Y285 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FARSAQ9Y285 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FARSAQ9Y285 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FARSAQ9Y285 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FARSAQ9Y285 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
FARSAQ9Y285 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FARSAQ9Y285 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FARSAQ9Y285 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FARSAQ9Y285 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FARSAQ9Y285 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FARSAQ9Y285 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FARSAQ9Y285 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FARSAQ9Y285 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FARSAQ9Y285 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FARSAQ9Y285 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FARSAQ9Y285 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FARSAQ9Y285 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FARSAQ9Y285 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FARSAQ9Y285 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FARSAQ9Y285 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FARSAQ9Y285 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FARSAQ9Y285 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FARSAQ9Y285 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FARSAQ9Y285 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FARSAQ9Y285 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FARSAQ9Y285 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FARSAQ9Y285 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FARSAQ9Y285 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FARSAQ9Y285 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FARSAQ9Y285 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FARSAQ9Y285 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FARSAQ9Y285 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FARSAQ9Y285 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FARSAQ9Y285 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FARSAQ9Y285 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FARSAQ9Y285 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FARSAQ9Y285 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FARSAQ9Y285 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FARSAQ9Y285 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FARSAQ9Y285 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FARSAQ9Y285 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FARSAQ9Y285 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FARSAQ9Y285 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FARSAQ9Y285 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FARSAQ9Y285 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FARSAQ9Y285 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FARSAQ9Y285 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
FARSAQ9Y285 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FARSAQ9Y285 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FARSAQ9Y285 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FARSAQ9Y285 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
FARSAQ9Y285 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FARSAQ9Y285 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FARSAQ9Y285 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FARSAQ9Y285 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FARSAQ9Y285 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
FARSAQ9Y285 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FARSAQ9Y285 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms