Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULC6

PADI1, Protein-arginine deiminase type-1, humanhuman

Predictions only

Length 663 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PADI1Q9ULC6 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PADI1Q9ULC6 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PADI1Q9ULC6 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PADI1Q9ULC6 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PADI1Q9ULC6 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PADI1Q9ULC6 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PADI1Q9ULC6 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PADI1Q9ULC6 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PADI1Q9ULC6 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PADI1Q9ULC6 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PADI1Q9ULC6 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PADI1Q9ULC6 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PADI1Q9ULC6 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PADI1Q9ULC6 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PADI1Q9ULC6 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PADI1Q9ULC6 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PADI1Q9ULC6 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PADI1Q9ULC6 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PADI1Q9ULC6 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PADI1Q9ULC6 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PADI1Q9ULC6 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PADI1Q9ULC6 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PADI1Q9ULC6 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PADI1Q9ULC6 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PADI1Q9ULC6 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PADI1Q9ULC6 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PADI1Q9ULC6 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PADI1Q9ULC6 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PADI1Q9ULC6 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PADI1Q9ULC6 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
PADI1Q9ULC6 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PADI1Q9ULC6 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PADI1Q9ULC6 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PADI1Q9ULC6 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
PADI1Q9ULC6 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PADI1Q9ULC6 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PADI1Q9ULC6 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PADI1Q9ULC6 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PADI1Q9ULC6 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PADI1Q9ULC6 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PADI1Q9ULC6 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PADI1Q9ULC6 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PADI1Q9ULC6 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PADI1Q9ULC6 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PADI1Q9ULC6 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PADI1Q9ULC6 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PADI1Q9ULC6 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PADI1Q9ULC6 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PADI1Q9ULC6 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PADI1Q9ULC6 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PADI1Q9ULC6 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PADI1Q9ULC6 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PADI1Q9ULC6 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PADI1Q9ULC6 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PADI1Q9ULC6 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PADI1Q9ULC6 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PADI1Q9ULC6 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PADI1Q9ULC6 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PADI1Q9ULC6 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PADI1Q9ULC6 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PADI1Q9ULC6 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PADI1Q9ULC6 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PADI1Q9ULC6 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PADI1Q9ULC6 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PADI1Q9ULC6 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PADI1Q9ULC6 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PADI1Q9ULC6 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PADI1Q9ULC6 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PADI1Q9ULC6 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PADI1Q9ULC6 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PADI1Q9ULC6 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PADI1Q9ULC6 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PADI1Q9ULC6 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PADI1Q9ULC6 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PADI1Q9ULC6 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PADI1Q9ULC6 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PADI1Q9ULC6 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PADI1Q9ULC6 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PADI1Q9ULC6 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PADI1Q9ULC6 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PADI1Q9ULC6 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PADI1Q9ULC6 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PADI1Q9ULC6 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PADI1Q9ULC6 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PADI1Q9ULC6 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PADI1Q9ULC6 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PADI1Q9ULC6 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PADI1Q9ULC6 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PADI1Q9ULC6 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PADI1Q9ULC6 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PADI1Q9ULC6 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PADI1Q9ULC6 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PADI1Q9ULC6 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PADI1Q9ULC6 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PADI1Q9ULC6 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PADI1Q9ULC6 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PADI1Q9ULC6 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PADI1Q9ULC6 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PADI1Q9ULC6 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PADI1Q9ULC6 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms