Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKZ1

CNOT11, CCR4-NOT transcription complex subunit 11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 510 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNOT11Q9UKZ1 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CNOT11Q9UKZ1 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CNOT11Q9UKZ1 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CNOT11Q9UKZ1 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CNOT11Q9UKZ1 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CNOT11Q9UKZ1 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CNOT11Q9UKZ1 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CNOT11Q9UKZ1 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CNOT11Q9UKZ1 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CNOT11Q9UKZ1 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CNOT11Q9UKZ1 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CNOT11Q9UKZ1 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CNOT11Q9UKZ1 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CNOT11Q9UKZ1 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CNOT11Q9UKZ1 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CNOT11Q9UKZ1 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CNOT11Q9UKZ1 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CNOT11Q9UKZ1 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CNOT11Q9UKZ1 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CNOT11Q9UKZ1 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CNOT11Q9UKZ1 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CNOT11Q9UKZ1 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CNOT11Q9UKZ1 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CNOT11Q9UKZ1 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CNOT11Q9UKZ1 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CNOT11Q9UKZ1 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CNOT11Q9UKZ1 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CNOT11Q9UKZ1 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CNOT11Q9UKZ1 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CNOT11Q9UKZ1 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CNOT11Q9UKZ1 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CNOT11Q9UKZ1 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CNOT11Q9UKZ1 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CNOT11Q9UKZ1 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CNOT11Q9UKZ1 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CNOT11Q9UKZ1 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CNOT11Q9UKZ1 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CNOT11Q9UKZ1 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CNOT11Q9UKZ1 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CNOT11Q9UKZ1 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CNOT11Q9UKZ1 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CNOT11Q9UKZ1 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CNOT11Q9UKZ1 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CNOT11Q9UKZ1 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CNOT11Q9UKZ1 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CNOT11Q9UKZ1 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CNOT11Q9UKZ1 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CNOT11Q9UKZ1 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CNOT11Q9UKZ1 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CNOT11Q9UKZ1 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CNOT11Q9UKZ1 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CNOT11Q9UKZ1 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CNOT11Q9UKZ1 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CNOT11Q9UKZ1 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CNOT11Q9UKZ1 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CNOT11Q9UKZ1 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CNOT11Q9UKZ1 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CNOT11Q9UKZ1 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CNOT11Q9UKZ1 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CNOT11Q9UKZ1 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CNOT11Q9UKZ1 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CNOT11Q9UKZ1 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CNOT11Q9UKZ1 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CNOT11Q9UKZ1 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CNOT11Q9UKZ1 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CNOT11Q9UKZ1 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CNOT11Q9UKZ1 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CNOT11Q9UKZ1 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CNOT11Q9UKZ1 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CNOT11Q9UKZ1 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CNOT11Q9UKZ1 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CNOT11Q9UKZ1 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CNOT11Q9UKZ1 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CNOT11Q9UKZ1 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CNOT11Q9UKZ1 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CNOT11Q9UKZ1 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CNOT11Q9UKZ1 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CNOT11Q9UKZ1 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CNOT11Q9UKZ1 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CNOT11Q9UKZ1 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CNOT11Q9UKZ1 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CNOT11Q9UKZ1 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CNOT11Q9UKZ1 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CNOT11Q9UKZ1 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CNOT11Q9UKZ1 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CNOT11Q9UKZ1 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CNOT11Q9UKZ1 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CNOT11Q9UKZ1 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CNOT11Q9UKZ1 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CNOT11Q9UKZ1 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CNOT11Q9UKZ1 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CNOT11Q9UKZ1 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CNOT11Q9UKZ1 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CNOT11Q9UKZ1 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CNOT11Q9UKZ1 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CNOT11Q9UKZ1 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CNOT11Q9UKZ1 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CNOT11Q9UKZ1 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CNOT11Q9UKZ1 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CNOT11Q9UKZ1 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms