Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBB9

TFIP11, Tuftelin-interacting protein 11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 837 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFIP11Q9UBB9 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TFIP11Q9UBB9 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TFIP11Q9UBB9 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TFIP11Q9UBB9 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TFIP11Q9UBB9 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TFIP11Q9UBB9 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TFIP11Q9UBB9 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
TFIP11Q9UBB9 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TFIP11Q9UBB9 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TFIP11Q9UBB9 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
TFIP11Q9UBB9 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TFIP11Q9UBB9 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TFIP11Q9UBB9 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TFIP11Q9UBB9 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TFIP11Q9UBB9 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TFIP11Q9UBB9 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TFIP11Q9UBB9 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
TFIP11Q9UBB9 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TFIP11Q9UBB9 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TFIP11Q9UBB9 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TFIP11Q9UBB9 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TFIP11Q9UBB9 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TFIP11Q9UBB9 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TFIP11Q9UBB9 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TFIP11Q9UBB9 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TFIP11Q9UBB9 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TFIP11Q9UBB9 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TFIP11Q9UBB9 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TFIP11Q9UBB9 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TFIP11Q9UBB9 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TFIP11Q9UBB9 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TFIP11Q9UBB9 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TFIP11Q9UBB9 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TFIP11Q9UBB9 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TFIP11Q9UBB9 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TFIP11Q9UBB9 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TFIP11Q9UBB9 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TFIP11Q9UBB9 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TFIP11Q9UBB9 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TFIP11Q9UBB9 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TFIP11Q9UBB9 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TFIP11Q9UBB9 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TFIP11Q9UBB9 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TFIP11Q9UBB9 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TFIP11Q9UBB9 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TFIP11Q9UBB9 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TFIP11Q9UBB9 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TFIP11Q9UBB9 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TFIP11Q9UBB9 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TFIP11Q9UBB9 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TFIP11Q9UBB9 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TFIP11Q9UBB9 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
TFIP11Q9UBB9 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TFIP11Q9UBB9 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TFIP11Q9UBB9 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TFIP11Q9UBB9 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TFIP11Q9UBB9 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
TFIP11Q9UBB9 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TFIP11Q9UBB9 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TFIP11Q9UBB9 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TFIP11Q9UBB9 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TFIP11Q9UBB9 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TFIP11Q9UBB9 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TFIP11Q9UBB9 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TFIP11Q9UBB9 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TFIP11Q9UBB9 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TFIP11Q9UBB9 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TFIP11Q9UBB9 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TFIP11Q9UBB9 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TFIP11Q9UBB9 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TFIP11Q9UBB9 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TFIP11Q9UBB9 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TFIP11Q9UBB9 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TFIP11Q9UBB9 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TFIP11Q9UBB9 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TFIP11Q9UBB9 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TFIP11Q9UBB9 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TFIP11Q9UBB9 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
TFIP11Q9UBB9 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TFIP11Q9UBB9 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
TFIP11Q9UBB9 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TFIP11Q9UBB9 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
TFIP11Q9UBB9 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TFIP11Q9UBB9 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
TFIP11Q9UBB9 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
TFIP11Q9UBB9 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TFIP11Q9UBB9 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TFIP11Q9UBB9 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
TFIP11Q9UBB9 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC19.68■□□□□ 0.74
TFIP11Q9UBB9 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
TFIP11Q9UBB9 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
TFIP11Q9UBB9 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC19.68■□□□□ 0.74
TFIP11Q9UBB9 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
TFIP11Q9UBB9 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
TFIP11Q9UBB9 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TFIP11Q9UBB9 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TFIP11Q9UBB9 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TFIP11Q9UBB9 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
TFIP11Q9UBB9 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
TFIP11Q9UBB9 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms