Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2N7

KLHL13, Kelch-like protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL13Q9P2N7 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHL13Q9P2N7 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHL13Q9P2N7 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHL13Q9P2N7 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHL13Q9P2N7 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHL13Q9P2N7 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHL13Q9P2N7 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHL13Q9P2N7 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHL13Q9P2N7 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHL13Q9P2N7 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHL13Q9P2N7 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHL13Q9P2N7 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHL13Q9P2N7 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHL13Q9P2N7 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHL13Q9P2N7 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHL13Q9P2N7 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHL13Q9P2N7 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHL13Q9P2N7 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHL13Q9P2N7 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHL13Q9P2N7 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHL13Q9P2N7 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHL13Q9P2N7 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHL13Q9P2N7 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHL13Q9P2N7 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL13Q9P2N7 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL13Q9P2N7 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL13Q9P2N7 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL13Q9P2N7 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL13Q9P2N7 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL13Q9P2N7 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL13Q9P2N7 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL13Q9P2N7 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL13Q9P2N7 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL13Q9P2N7 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL13Q9P2N7 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL13Q9P2N7 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL13Q9P2N7 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL13Q9P2N7 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL13Q9P2N7 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL13Q9P2N7 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL13Q9P2N7 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL13Q9P2N7 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL13Q9P2N7 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL13Q9P2N7 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL13Q9P2N7 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL13Q9P2N7 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL13Q9P2N7 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL13Q9P2N7 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL13Q9P2N7 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL13Q9P2N7 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL13Q9P2N7 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL13Q9P2N7 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL13Q9P2N7 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL13Q9P2N7 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL13Q9P2N7 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL13Q9P2N7 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL13Q9P2N7 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL13Q9P2N7 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL13Q9P2N7 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL13Q9P2N7 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL13Q9P2N7 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL13Q9P2N7 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL13Q9P2N7 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL13Q9P2N7 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL13Q9P2N7 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL13Q9P2N7 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHL13Q9P2N7 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHL13Q9P2N7 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHL13Q9P2N7 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHL13Q9P2N7 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHL13Q9P2N7 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHL13Q9P2N7 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHL13Q9P2N7 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHL13Q9P2N7 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHL13Q9P2N7 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHL13Q9P2N7 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHL13Q9P2N7 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHL13Q9P2N7 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHL13Q9P2N7 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHL13Q9P2N7 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHL13Q9P2N7 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHL13Q9P2N7 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHL13Q9P2N7 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHL13Q9P2N7 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHL13Q9P2N7 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHL13Q9P2N7 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHL13Q9P2N7 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHL13Q9P2N7 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHL13Q9P2N7 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHL13Q9P2N7 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHL13Q9P2N7 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHL13Q9P2N7 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHL13Q9P2N7 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHL13Q9P2N7 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHL13Q9P2N7 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHL13Q9P2N7 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHL13Q9P2N7 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHL13Q9P2N7 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHL13Q9P2N7 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHL13Q9P2N7 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms