Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2H5

USP35, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 35, humanhuman

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Length 1,018 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP35Q9P2H5 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
USP35Q9P2H5 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
USP35Q9P2H5 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
USP35Q9P2H5 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
USP35Q9P2H5 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
USP35Q9P2H5 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
USP35Q9P2H5 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
USP35Q9P2H5 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
USP35Q9P2H5 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
USP35Q9P2H5 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
USP35Q9P2H5 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
USP35Q9P2H5 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
USP35Q9P2H5 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
USP35Q9P2H5 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC23■■□□□ 1.27
USP35Q9P2H5 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
USP35Q9P2H5 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
USP35Q9P2H5 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
USP35Q9P2H5 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
USP35Q9P2H5 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
USP35Q9P2H5 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
USP35Q9P2H5 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
USP35Q9P2H5 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
USP35Q9P2H5 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
USP35Q9P2H5 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC23■■□□□ 1.27
USP35Q9P2H5 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC23■■□□□ 1.27
USP35Q9P2H5 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
USP35Q9P2H5 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
USP35Q9P2H5 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
USP35Q9P2H5 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
USP35Q9P2H5 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
USP35Q9P2H5 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
USP35Q9P2H5 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
USP35Q9P2H5 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
USP35Q9P2H5 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
USP35Q9P2H5 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
USP35Q9P2H5 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
USP35Q9P2H5 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
USP35Q9P2H5 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
USP35Q9P2H5 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
USP35Q9P2H5 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
USP35Q9P2H5 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
USP35Q9P2H5 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
USP35Q9P2H5 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
USP35Q9P2H5 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
USP35Q9P2H5 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
USP35Q9P2H5 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
USP35Q9P2H5 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
USP35Q9P2H5 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
USP35Q9P2H5 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
USP35Q9P2H5 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
USP35Q9P2H5 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
USP35Q9P2H5 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
USP35Q9P2H5 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
USP35Q9P2H5 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
USP35Q9P2H5 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
USP35Q9P2H5 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
USP35Q9P2H5 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
USP35Q9P2H5 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
USP35Q9P2H5 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
USP35Q9P2H5 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
USP35Q9P2H5 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
USP35Q9P2H5 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
USP35Q9P2H5 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
USP35Q9P2H5 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
USP35Q9P2H5 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
USP35Q9P2H5 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
USP35Q9P2H5 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
USP35Q9P2H5 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
USP35Q9P2H5 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
USP35Q9P2H5 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
USP35Q9P2H5 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
USP35Q9P2H5 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
USP35Q9P2H5 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
USP35Q9P2H5 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
USP35Q9P2H5 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
USP35Q9P2H5 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
USP35Q9P2H5 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
USP35Q9P2H5 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
USP35Q9P2H5 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
USP35Q9P2H5 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
USP35Q9P2H5 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
USP35Q9P2H5 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
USP35Q9P2H5 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
USP35Q9P2H5 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
USP35Q9P2H5 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
USP35Q9P2H5 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
USP35Q9P2H5 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
USP35Q9P2H5 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
USP35Q9P2H5 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
USP35Q9P2H5 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
USP35Q9P2H5 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
USP35Q9P2H5 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
USP35Q9P2H5 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
USP35Q9P2H5 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
USP35Q9P2H5 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
USP35Q9P2H5 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
USP35Q9P2H5 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
USP35Q9P2H5 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
USP35Q9P2H5 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
USP35Q9P2H5 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
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