Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z3

HCN3, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 3, humanhuman

Predictions only

Length 774 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCN3Q9P1Z3 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HCN3Q9P1Z3 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HCN3Q9P1Z3 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HCN3Q9P1Z3 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HCN3Q9P1Z3 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HCN3Q9P1Z3 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HCN3Q9P1Z3 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HCN3Q9P1Z3 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HCN3Q9P1Z3 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HCN3Q9P1Z3 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HCN3Q9P1Z3 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HCN3Q9P1Z3 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HCN3Q9P1Z3 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
HCN3Q9P1Z3 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HCN3Q9P1Z3 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
HCN3Q9P1Z3 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HCN3Q9P1Z3 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HCN3Q9P1Z3 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
HCN3Q9P1Z3 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
HCN3Q9P1Z3 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
HCN3Q9P1Z3 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
HCN3Q9P1Z3 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
HCN3Q9P1Z3 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
HCN3Q9P1Z3 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
HCN3Q9P1Z3 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
HCN3Q9P1Z3 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
HCN3Q9P1Z3 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
HCN3Q9P1Z3 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
HCN3Q9P1Z3 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
HCN3Q9P1Z3 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HCN3Q9P1Z3 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HCN3Q9P1Z3 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HCN3Q9P1Z3 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HCN3Q9P1Z3 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HCN3Q9P1Z3 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HCN3Q9P1Z3 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HCN3Q9P1Z3 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HCN3Q9P1Z3 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HCN3Q9P1Z3 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HCN3Q9P1Z3 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HCN3Q9P1Z3 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HCN3Q9P1Z3 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
HCN3Q9P1Z3 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HCN3Q9P1Z3 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HCN3Q9P1Z3 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HCN3Q9P1Z3 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HCN3Q9P1Z3 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HCN3Q9P1Z3 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HCN3Q9P1Z3 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HCN3Q9P1Z3 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HCN3Q9P1Z3 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HCN3Q9P1Z3 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HCN3Q9P1Z3 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HCN3Q9P1Z3 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
HCN3Q9P1Z3 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HCN3Q9P1Z3 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HCN3Q9P1Z3 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HCN3Q9P1Z3 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
HCN3Q9P1Z3 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HCN3Q9P1Z3 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HCN3Q9P1Z3 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HCN3Q9P1Z3 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HCN3Q9P1Z3 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HCN3Q9P1Z3 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HCN3Q9P1Z3 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HCN3Q9P1Z3 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HCN3Q9P1Z3 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HCN3Q9P1Z3 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HCN3Q9P1Z3 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HCN3Q9P1Z3 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HCN3Q9P1Z3 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HCN3Q9P1Z3 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HCN3Q9P1Z3 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
HCN3Q9P1Z3 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HCN3Q9P1Z3 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HCN3Q9P1Z3 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HCN3Q9P1Z3 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HCN3Q9P1Z3 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HCN3Q9P1Z3 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HCN3Q9P1Z3 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HCN3Q9P1Z3 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HCN3Q9P1Z3 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
HCN3Q9P1Z3 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HCN3Q9P1Z3 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HCN3Q9P1Z3 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
HCN3Q9P1Z3 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HCN3Q9P1Z3 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HCN3Q9P1Z3 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HCN3Q9P1Z3 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HCN3Q9P1Z3 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HCN3Q9P1Z3 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HCN3Q9P1Z3 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HCN3Q9P1Z3 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HCN3Q9P1Z3 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HCN3Q9P1Z3 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HCN3Q9P1Z3 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HCN3Q9P1Z3 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HCN3Q9P1Z3 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HCN3Q9P1Z3 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HCN3Q9P1Z3 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms