Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXS3

KLHL28, Kelch-like protein 28, humanhuman

Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL28Q9NXS3 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
KLHL28Q9NXS3 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KLHL28Q9NXS3 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KLHL28Q9NXS3 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KLHL28Q9NXS3 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KLHL28Q9NXS3 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
KLHL28Q9NXS3 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KLHL28Q9NXS3 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KLHL28Q9NXS3 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
KLHL28Q9NXS3 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KLHL28Q9NXS3 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHL28Q9NXS3 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHL28Q9NXS3 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHL28Q9NXS3 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHL28Q9NXS3 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHL28Q9NXS3 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHL28Q9NXS3 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHL28Q9NXS3 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHL28Q9NXS3 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHL28Q9NXS3 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHL28Q9NXS3 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHL28Q9NXS3 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHL28Q9NXS3 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHL28Q9NXS3 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHL28Q9NXS3 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHL28Q9NXS3 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHL28Q9NXS3 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHL28Q9NXS3 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHL28Q9NXS3 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHL28Q9NXS3 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHL28Q9NXS3 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHL28Q9NXS3 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHL28Q9NXS3 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHL28Q9NXS3 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHL28Q9NXS3 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHL28Q9NXS3 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHL28Q9NXS3 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHL28Q9NXS3 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHL28Q9NXS3 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHL28Q9NXS3 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHL28Q9NXS3 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHL28Q9NXS3 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHL28Q9NXS3 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHL28Q9NXS3 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHL28Q9NXS3 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHL28Q9NXS3 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHL28Q9NXS3 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHL28Q9NXS3 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHL28Q9NXS3 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHL28Q9NXS3 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHL28Q9NXS3 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHL28Q9NXS3 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHL28Q9NXS3 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHL28Q9NXS3 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHL28Q9NXS3 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHL28Q9NXS3 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHL28Q9NXS3 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHL28Q9NXS3 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHL28Q9NXS3 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHL28Q9NXS3 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHL28Q9NXS3 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHL28Q9NXS3 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHL28Q9NXS3 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHL28Q9NXS3 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHL28Q9NXS3 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHL28Q9NXS3 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHL28Q9NXS3 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHL28Q9NXS3 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHL28Q9NXS3 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHL28Q9NXS3 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHL28Q9NXS3 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHL28Q9NXS3 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHL28Q9NXS3 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHL28Q9NXS3 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHL28Q9NXS3 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHL28Q9NXS3 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHL28Q9NXS3 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHL28Q9NXS3 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHL28Q9NXS3 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHL28Q9NXS3 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHL28Q9NXS3 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHL28Q9NXS3 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHL28Q9NXS3 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHL28Q9NXS3 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHL28Q9NXS3 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHL28Q9NXS3 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHL28Q9NXS3 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHL28Q9NXS3 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHL28Q9NXS3 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHL28Q9NXS3 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHL28Q9NXS3 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHL28Q9NXS3 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHL28Q9NXS3 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHL28Q9NXS3 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHL28Q9NXS3 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHL28Q9NXS3 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHL28Q9NXS3 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHL28Q9NXS3 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHL28Q9NXS3 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHL28Q9NXS3 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms