Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVP2

ASF1B, Histone chaperone ASF1B, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASF1BQ9NVP2 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ASF1BQ9NVP2 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ASF1BQ9NVP2 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ASF1BQ9NVP2 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ASF1BQ9NVP2 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ASF1BQ9NVP2 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ASF1BQ9NVP2 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ASF1BQ9NVP2 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ASF1BQ9NVP2 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ASF1BQ9NVP2 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ASF1BQ9NVP2 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ASF1BQ9NVP2 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ASF1BQ9NVP2 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ASF1BQ9NVP2 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ASF1BQ9NVP2 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ASF1BQ9NVP2 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ASF1BQ9NVP2 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ASF1BQ9NVP2 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ASF1BQ9NVP2 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ASF1BQ9NVP2 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ASF1BQ9NVP2 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ASF1BQ9NVP2 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ASF1BQ9NVP2 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ASF1BQ9NVP2 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ASF1BQ9NVP2 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ASF1BQ9NVP2 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ASF1BQ9NVP2 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ASF1BQ9NVP2 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ASF1BQ9NVP2 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ASF1BQ9NVP2 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ASF1BQ9NVP2 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ASF1BQ9NVP2 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ASF1BQ9NVP2 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ASF1BQ9NVP2 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ASF1BQ9NVP2 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ASF1BQ9NVP2 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ASF1BQ9NVP2 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ASF1BQ9NVP2 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ASF1BQ9NVP2 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ASF1BQ9NVP2 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ASF1BQ9NVP2 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ASF1BQ9NVP2 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ASF1BQ9NVP2 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ASF1BQ9NVP2 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ASF1BQ9NVP2 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ASF1BQ9NVP2 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ASF1BQ9NVP2 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ASF1BQ9NVP2 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ASF1BQ9NVP2 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ASF1BQ9NVP2 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ASF1BQ9NVP2 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ASF1BQ9NVP2 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ASF1BQ9NVP2 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ASF1BQ9NVP2 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ASF1BQ9NVP2 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ASF1BQ9NVP2 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ASF1BQ9NVP2 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ASF1BQ9NVP2 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ASF1BQ9NVP2 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ASF1BQ9NVP2 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ASF1BQ9NVP2 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ASF1BQ9NVP2 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ASF1BQ9NVP2 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ASF1BQ9NVP2 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ASF1BQ9NVP2 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ASF1BQ9NVP2 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ASF1BQ9NVP2 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ASF1BQ9NVP2 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ASF1BQ9NVP2 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ASF1BQ9NVP2 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ASF1BQ9NVP2 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ASF1BQ9NVP2 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ASF1BQ9NVP2 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ASF1BQ9NVP2 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ASF1BQ9NVP2 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ASF1BQ9NVP2 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ASF1BQ9NVP2 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ASF1BQ9NVP2 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ASF1BQ9NVP2 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ASF1BQ9NVP2 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ASF1BQ9NVP2 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ASF1BQ9NVP2 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ASF1BQ9NVP2 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ASF1BQ9NVP2 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ASF1BQ9NVP2 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ASF1BQ9NVP2 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ASF1BQ9NVP2 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ASF1BQ9NVP2 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ASF1BQ9NVP2 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ASF1BQ9NVP2 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
ASF1BQ9NVP2 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ASF1BQ9NVP2 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ASF1BQ9NVP2 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ASF1BQ9NVP2 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ASF1BQ9NVP2 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ASF1BQ9NVP2 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ASF1BQ9NVP2 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ASF1BQ9NVP2 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ASF1BQ9NVP2 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
ASF1BQ9NVP2 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms