Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTK1

DEPP, Protein DEPP, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEPPQ9NTK1 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DEPPQ9NTK1 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
DEPPQ9NTK1 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DEPPQ9NTK1 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DEPPQ9NTK1 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DEPPQ9NTK1 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DEPPQ9NTK1 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DEPPQ9NTK1 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DEPPQ9NTK1 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DEPPQ9NTK1 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DEPPQ9NTK1 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DEPPQ9NTK1 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DEPPQ9NTK1 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DEPPQ9NTK1 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DEPPQ9NTK1 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DEPPQ9NTK1 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DEPPQ9NTK1 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DEPPQ9NTK1 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DEPPQ9NTK1 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DEPPQ9NTK1 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DEPPQ9NTK1 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DEPPQ9NTK1 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DEPPQ9NTK1 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DEPPQ9NTK1 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DEPPQ9NTK1 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DEPPQ9NTK1 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DEPPQ9NTK1 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DEPPQ9NTK1 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DEPPQ9NTK1 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
DEPPQ9NTK1 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
DEPPQ9NTK1 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DEPPQ9NTK1 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DEPPQ9NTK1 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DEPPQ9NTK1 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DEPPQ9NTK1 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DEPPQ9NTK1 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DEPPQ9NTK1 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DEPPQ9NTK1 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DEPPQ9NTK1 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DEPPQ9NTK1 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DEPPQ9NTK1 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DEPPQ9NTK1 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DEPPQ9NTK1 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DEPPQ9NTK1 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DEPPQ9NTK1 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DEPPQ9NTK1 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DEPPQ9NTK1 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DEPPQ9NTK1 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DEPPQ9NTK1 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DEPPQ9NTK1 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DEPPQ9NTK1 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DEPPQ9NTK1 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DEPPQ9NTK1 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DEPPQ9NTK1 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DEPPQ9NTK1 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DEPPQ9NTK1 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DEPPQ9NTK1 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DEPPQ9NTK1 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DEPPQ9NTK1 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DEPPQ9NTK1 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DEPPQ9NTK1 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
DEPPQ9NTK1 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DEPPQ9NTK1 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
DEPPQ9NTK1 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
DEPPQ9NTK1 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
DEPPQ9NTK1 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DEPPQ9NTK1 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DEPPQ9NTK1 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DEPPQ9NTK1 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DEPPQ9NTK1 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DEPPQ9NTK1 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DEPPQ9NTK1 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DEPPQ9NTK1 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DEPPQ9NTK1 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DEPPQ9NTK1 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DEPPQ9NTK1 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DEPPQ9NTK1 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
DEPPQ9NTK1 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DEPPQ9NTK1 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DEPPQ9NTK1 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DEPPQ9NTK1 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DEPPQ9NTK1 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DEPPQ9NTK1 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DEPPQ9NTK1 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DEPPQ9NTK1 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DEPPQ9NTK1 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DEPPQ9NTK1 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DEPPQ9NTK1 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DEPPQ9NTK1 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DEPPQ9NTK1 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DEPPQ9NTK1 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
DEPPQ9NTK1 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DEPPQ9NTK1 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DEPPQ9NTK1 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DEPPQ9NTK1 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DEPPQ9NTK1 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DEPPQ9NTK1 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DEPPQ9NTK1 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DEPPQ9NTK1 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DEPPQ9NTK1 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.1 ms