Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS93

TM7SF3, Transmembrane 7 superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM7SF3Q9NS93 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TM7SF3Q9NS93 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TM7SF3Q9NS93 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TM7SF3Q9NS93 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TM7SF3Q9NS93 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TM7SF3Q9NS93 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TM7SF3Q9NS93 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TM7SF3Q9NS93 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TM7SF3Q9NS93 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TM7SF3Q9NS93 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
TM7SF3Q9NS93 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
TM7SF3Q9NS93 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
TM7SF3Q9NS93 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
TM7SF3Q9NS93 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
TM7SF3Q9NS93 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TM7SF3Q9NS93 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TM7SF3Q9NS93 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TM7SF3Q9NS93 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TM7SF3Q9NS93 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
TM7SF3Q9NS93 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TM7SF3Q9NS93 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TM7SF3Q9NS93 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TM7SF3Q9NS93 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TM7SF3Q9NS93 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TM7SF3Q9NS93 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TM7SF3Q9NS93 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TM7SF3Q9NS93 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TM7SF3Q9NS93 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TM7SF3Q9NS93 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TM7SF3Q9NS93 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TM7SF3Q9NS93 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TM7SF3Q9NS93 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TM7SF3Q9NS93 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
TM7SF3Q9NS93 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TM7SF3Q9NS93 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TM7SF3Q9NS93 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TM7SF3Q9NS93 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TM7SF3Q9NS93 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TM7SF3Q9NS93 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TM7SF3Q9NS93 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TM7SF3Q9NS93 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TM7SF3Q9NS93 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TM7SF3Q9NS93 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TM7SF3Q9NS93 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TM7SF3Q9NS93 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TM7SF3Q9NS93 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TM7SF3Q9NS93 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TM7SF3Q9NS93 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TM7SF3Q9NS93 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TM7SF3Q9NS93 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
TM7SF3Q9NS93 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TM7SF3Q9NS93 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TM7SF3Q9NS93 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
TM7SF3Q9NS93 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TM7SF3Q9NS93 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TM7SF3Q9NS93 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TM7SF3Q9NS93 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TM7SF3Q9NS93 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TM7SF3Q9NS93 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TM7SF3Q9NS93 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TM7SF3Q9NS93 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TM7SF3Q9NS93 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TM7SF3Q9NS93 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TM7SF3Q9NS93 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TM7SF3Q9NS93 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TM7SF3Q9NS93 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TM7SF3Q9NS93 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TM7SF3Q9NS93 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TM7SF3Q9NS93 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TM7SF3Q9NS93 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TM7SF3Q9NS93 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TM7SF3Q9NS93 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TM7SF3Q9NS93 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TM7SF3Q9NS93 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TM7SF3Q9NS93 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TM7SF3Q9NS93 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TM7SF3Q9NS93 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TM7SF3Q9NS93 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TM7SF3Q9NS93 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TM7SF3Q9NS93 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TM7SF3Q9NS93 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TM7SF3Q9NS93 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
TM7SF3Q9NS93 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TM7SF3Q9NS93 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TM7SF3Q9NS93 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TM7SF3Q9NS93 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TM7SF3Q9NS93 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TM7SF3Q9NS93 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TM7SF3Q9NS93 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
TM7SF3Q9NS93 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TM7SF3Q9NS93 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
TM7SF3Q9NS93 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TM7SF3Q9NS93 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
TM7SF3Q9NS93 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TM7SF3Q9NS93 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TM7SF3Q9NS93 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TM7SF3Q9NS93 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TM7SF3Q9NS93 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TM7SF3Q9NS93 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TM7SF3Q9NS93 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.4 ms