Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPI8

FANCF, Fanconi anemia group F protein, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCFQ9NPI8 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FANCFQ9NPI8 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FANCFQ9NPI8 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FANCFQ9NPI8 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
FANCFQ9NPI8 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FANCFQ9NPI8 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FANCFQ9NPI8 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
FANCFQ9NPI8 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FANCFQ9NPI8 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FANCFQ9NPI8 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FANCFQ9NPI8 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FANCFQ9NPI8 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FANCFQ9NPI8 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
FANCFQ9NPI8 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FANCFQ9NPI8 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FANCFQ9NPI8 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FANCFQ9NPI8 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FANCFQ9NPI8 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
FANCFQ9NPI8 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FANCFQ9NPI8 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FANCFQ9NPI8 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FANCFQ9NPI8 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FANCFQ9NPI8 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FANCFQ9NPI8 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FANCFQ9NPI8 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FANCFQ9NPI8 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FANCFQ9NPI8 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FANCFQ9NPI8 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
FANCFQ9NPI8 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
FANCFQ9NPI8 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
FANCFQ9NPI8 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
FANCFQ9NPI8 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
FANCFQ9NPI8 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
FANCFQ9NPI8 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
FANCFQ9NPI8 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
FANCFQ9NPI8 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
FANCFQ9NPI8 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
FANCFQ9NPI8 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
FANCFQ9NPI8 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
FANCFQ9NPI8 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
FANCFQ9NPI8 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
FANCFQ9NPI8 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FANCFQ9NPI8 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FANCFQ9NPI8 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FANCFQ9NPI8 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FANCFQ9NPI8 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
FANCFQ9NPI8 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FANCFQ9NPI8 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FANCFQ9NPI8 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FANCFQ9NPI8 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FANCFQ9NPI8 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FANCFQ9NPI8 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FANCFQ9NPI8 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FANCFQ9NPI8 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FANCFQ9NPI8 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FANCFQ9NPI8 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
FANCFQ9NPI8 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FANCFQ9NPI8 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
FANCFQ9NPI8 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FANCFQ9NPI8 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FANCFQ9NPI8 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FANCFQ9NPI8 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FANCFQ9NPI8 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FANCFQ9NPI8 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FANCFQ9NPI8 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FANCFQ9NPI8 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FANCFQ9NPI8 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FANCFQ9NPI8 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FANCFQ9NPI8 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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FANCFQ9NPI8 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FANCFQ9NPI8 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FANCFQ9NPI8 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FANCFQ9NPI8 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FANCFQ9NPI8 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FANCFQ9NPI8 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FANCFQ9NPI8 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FANCFQ9NPI8 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FANCFQ9NPI8 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FANCFQ9NPI8 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FANCFQ9NPI8 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FANCFQ9NPI8 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FANCFQ9NPI8 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FANCFQ9NPI8 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FANCFQ9NPI8 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FANCFQ9NPI8 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FANCFQ9NPI8 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FANCFQ9NPI8 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
FANCFQ9NPI8 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FANCFQ9NPI8 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FANCFQ9NPI8 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FANCFQ9NPI8 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FANCFQ9NPI8 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FANCFQ9NPI8 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FANCFQ9NPI8 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FANCFQ9NPI8 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FANCFQ9NPI8 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
FANCFQ9NPI8 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FANCFQ9NPI8 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
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