Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP66

HMG20A, High mobility group protein 20A, humanhuman

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Length 347 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMG20AQ9NP66 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
HMG20AQ9NP66 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
HMG20AQ9NP66 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
HMG20AQ9NP66 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
HMG20AQ9NP66 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
HMG20AQ9NP66 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
HMG20AQ9NP66 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HMG20AQ9NP66 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HMG20AQ9NP66 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HMG20AQ9NP66 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HMG20AQ9NP66 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HMG20AQ9NP66 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HMG20AQ9NP66 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HMG20AQ9NP66 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HMG20AQ9NP66 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HMG20AQ9NP66 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HMG20AQ9NP66 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HMG20AQ9NP66 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HMG20AQ9NP66 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HMG20AQ9NP66 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HMG20AQ9NP66 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HMG20AQ9NP66 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HMG20AQ9NP66 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
HMG20AQ9NP66 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
HMG20AQ9NP66 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HMG20AQ9NP66 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HMG20AQ9NP66 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HMG20AQ9NP66 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HMG20AQ9NP66 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HMG20AQ9NP66 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HMG20AQ9NP66 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
HMG20AQ9NP66 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HMG20AQ9NP66 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HMG20AQ9NP66 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HMG20AQ9NP66 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HMG20AQ9NP66 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HMG20AQ9NP66 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HMG20AQ9NP66 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HMG20AQ9NP66 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HMG20AQ9NP66 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HMG20AQ9NP66 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HMG20AQ9NP66 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HMG20AQ9NP66 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HMG20AQ9NP66 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HMG20AQ9NP66 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HMG20AQ9NP66 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HMG20AQ9NP66 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HMG20AQ9NP66 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HMG20AQ9NP66 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HMG20AQ9NP66 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HMG20AQ9NP66 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HMG20AQ9NP66 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HMG20AQ9NP66 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HMG20AQ9NP66 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HMG20AQ9NP66 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HMG20AQ9NP66 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HMG20AQ9NP66 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
HMG20AQ9NP66 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
HMG20AQ9NP66 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
HMG20AQ9NP66 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HMG20AQ9NP66 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HMG20AQ9NP66 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HMG20AQ9NP66 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HMG20AQ9NP66 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
HMG20AQ9NP66 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HMG20AQ9NP66 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HMG20AQ9NP66 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HMG20AQ9NP66 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HMG20AQ9NP66 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
HMG20AQ9NP66 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HMG20AQ9NP66 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HMG20AQ9NP66 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HMG20AQ9NP66 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HMG20AQ9NP66 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HMG20AQ9NP66 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HMG20AQ9NP66 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HMG20AQ9NP66 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HMG20AQ9NP66 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HMG20AQ9NP66 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
HMG20AQ9NP66 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HMG20AQ9NP66 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HMG20AQ9NP66 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HMG20AQ9NP66 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HMG20AQ9NP66 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
HMG20AQ9NP66 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HMG20AQ9NP66 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HMG20AQ9NP66 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HMG20AQ9NP66 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HMG20AQ9NP66 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HMG20AQ9NP66 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HMG20AQ9NP66 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HMG20AQ9NP66 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HMG20AQ9NP66 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HMG20AQ9NP66 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HMG20AQ9NP66 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HMG20AQ9NP66 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HMG20AQ9NP66 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
HMG20AQ9NP66 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
HMG20AQ9NP66 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HMG20AQ9NP66 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
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