Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZS1

POLR1E, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA49, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1EQ9GZS1 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
POLR1EQ9GZS1 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
POLR1EQ9GZS1 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
POLR1EQ9GZS1 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
POLR1EQ9GZS1 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
POLR1EQ9GZS1 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
POLR1EQ9GZS1 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
POLR1EQ9GZS1 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
POLR1EQ9GZS1 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
POLR1EQ9GZS1 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
POLR1EQ9GZS1 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
POLR1EQ9GZS1 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
POLR1EQ9GZS1 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
POLR1EQ9GZS1 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
POLR1EQ9GZS1 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
POLR1EQ9GZS1 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
POLR1EQ9GZS1 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
POLR1EQ9GZS1 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
POLR1EQ9GZS1 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
POLR1EQ9GZS1 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
POLR1EQ9GZS1 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
POLR1EQ9GZS1 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
POLR1EQ9GZS1 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
POLR1EQ9GZS1 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
POLR1EQ9GZS1 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
POLR1EQ9GZS1 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
POLR1EQ9GZS1 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
POLR1EQ9GZS1 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
POLR1EQ9GZS1 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
POLR1EQ9GZS1 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
POLR1EQ9GZS1 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
POLR1EQ9GZS1 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
POLR1EQ9GZS1 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
POLR1EQ9GZS1 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
POLR1EQ9GZS1 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
POLR1EQ9GZS1 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
POLR1EQ9GZS1 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
POLR1EQ9GZS1 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
POLR1EQ9GZS1 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
POLR1EQ9GZS1 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
POLR1EQ9GZS1 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
POLR1EQ9GZS1 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
POLR1EQ9GZS1 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
POLR1EQ9GZS1 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
POLR1EQ9GZS1 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
POLR1EQ9GZS1 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
POLR1EQ9GZS1 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
POLR1EQ9GZS1 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
POLR1EQ9GZS1 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
POLR1EQ9GZS1 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
POLR1EQ9GZS1 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
POLR1EQ9GZS1 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
POLR1EQ9GZS1 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
POLR1EQ9GZS1 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
POLR1EQ9GZS1 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
POLR1EQ9GZS1 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
POLR1EQ9GZS1 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
POLR1EQ9GZS1 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
POLR1EQ9GZS1 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
POLR1EQ9GZS1 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
POLR1EQ9GZS1 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
POLR1EQ9GZS1 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
POLR1EQ9GZS1 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
POLR1EQ9GZS1 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
POLR1EQ9GZS1 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
POLR1EQ9GZS1 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
POLR1EQ9GZS1 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
POLR1EQ9GZS1 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
POLR1EQ9GZS1 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
POLR1EQ9GZS1 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
POLR1EQ9GZS1 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
POLR1EQ9GZS1 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
POLR1EQ9GZS1 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
POLR1EQ9GZS1 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
POLR1EQ9GZS1 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
POLR1EQ9GZS1 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
POLR1EQ9GZS1 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
POLR1EQ9GZS1 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
POLR1EQ9GZS1 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
POLR1EQ9GZS1 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
POLR1EQ9GZS1 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
POLR1EQ9GZS1 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
POLR1EQ9GZS1 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
POLR1EQ9GZS1 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
POLR1EQ9GZS1 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
POLR1EQ9GZS1 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
POLR1EQ9GZS1 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
POLR1EQ9GZS1 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
POLR1EQ9GZS1 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
POLR1EQ9GZS1 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
POLR1EQ9GZS1 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
POLR1EQ9GZS1 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
POLR1EQ9GZS1 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
POLR1EQ9GZS1 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
POLR1EQ9GZS1 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
POLR1EQ9GZS1 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
POLR1EQ9GZS1 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
POLR1EQ9GZS1 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
POLR1EQ9GZS1 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
POLR1EQ9GZS1 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.3 ms