Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0B2

CFAP74, Cilia- and flagella-associated protein 74, humanhuman

Predictions only

Length 1,584 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP74Q9C0B2 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CFAP74Q9C0B2 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CFAP74Q9C0B2 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CFAP74Q9C0B2 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CFAP74Q9C0B2 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
CFAP74Q9C0B2 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CFAP74Q9C0B2 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CFAP74Q9C0B2 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
CFAP74Q9C0B2 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CFAP74Q9C0B2 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
CFAP74Q9C0B2 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
CFAP74Q9C0B2 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CFAP74Q9C0B2 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CFAP74Q9C0B2 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CFAP74Q9C0B2 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CFAP74Q9C0B2 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
CFAP74Q9C0B2 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CFAP74Q9C0B2 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CFAP74Q9C0B2 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CFAP74Q9C0B2 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CFAP74Q9C0B2 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CFAP74Q9C0B2 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CFAP74Q9C0B2 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CFAP74Q9C0B2 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CFAP74Q9C0B2 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CFAP74Q9C0B2 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CFAP74Q9C0B2 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CFAP74Q9C0B2 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CFAP74Q9C0B2 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CFAP74Q9C0B2 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CFAP74Q9C0B2 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
CFAP74Q9C0B2 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CFAP74Q9C0B2 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CFAP74Q9C0B2 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CFAP74Q9C0B2 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CFAP74Q9C0B2 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CFAP74Q9C0B2 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CFAP74Q9C0B2 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
CFAP74Q9C0B2 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CFAP74Q9C0B2 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CFAP74Q9C0B2 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CFAP74Q9C0B2 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CFAP74Q9C0B2 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CFAP74Q9C0B2 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
CFAP74Q9C0B2 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CFAP74Q9C0B2 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CFAP74Q9C0B2 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CFAP74Q9C0B2 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CFAP74Q9C0B2 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.63
CFAP74Q9C0B2 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
CFAP74Q9C0B2 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CFAP74Q9C0B2 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CFAP74Q9C0B2 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
CFAP74Q9C0B2 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CFAP74Q9C0B2 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CFAP74Q9C0B2 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CFAP74Q9C0B2 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CFAP74Q9C0B2 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CFAP74Q9C0B2 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CFAP74Q9C0B2 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CFAP74Q9C0B2 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CFAP74Q9C0B2 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CFAP74Q9C0B2 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CFAP74Q9C0B2 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
CFAP74Q9C0B2 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CFAP74Q9C0B2 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CFAP74Q9C0B2 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CFAP74Q9C0B2 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
CFAP74Q9C0B2 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CFAP74Q9C0B2 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CFAP74Q9C0B2 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CFAP74Q9C0B2 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CFAP74Q9C0B2 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CFAP74Q9C0B2 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CFAP74Q9C0B2 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CFAP74Q9C0B2 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CFAP74Q9C0B2 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CFAP74Q9C0B2 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CFAP74Q9C0B2 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CFAP74Q9C0B2 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CFAP74Q9C0B2 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CFAP74Q9C0B2 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CFAP74Q9C0B2 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CFAP74Q9C0B2 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CFAP74Q9C0B2 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CFAP74Q9C0B2 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CFAP74Q9C0B2 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CFAP74Q9C0B2 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CFAP74Q9C0B2 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CFAP74Q9C0B2 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
CFAP74Q9C0B2 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
CFAP74Q9C0B2 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CFAP74Q9C0B2 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CFAP74Q9C0B2 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CFAP74Q9C0B2 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
CFAP74Q9C0B2 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CFAP74Q9C0B2 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
CFAP74Q9C0B2 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
CFAP74Q9C0B2 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CFAP74Q9C0B2 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms