Protein–RNA interactions for Protein: Q9C000

NLRP1, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP1Q9C000 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NLRP1Q9C000 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NLRP1Q9C000 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NLRP1Q9C000 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
NLRP1Q9C000 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NLRP1Q9C000 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
NLRP1Q9C000 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
NLRP1Q9C000 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NLRP1Q9C000 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NLRP1Q9C000 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
NLRP1Q9C000 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NLRP1Q9C000 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NLRP1Q9C000 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
NLRP1Q9C000 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NLRP1Q9C000 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NLRP1Q9C000 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NLRP1Q9C000 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NLRP1Q9C000 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NLRP1Q9C000 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NLRP1Q9C000 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NLRP1Q9C000 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NLRP1Q9C000 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NLRP1Q9C000 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NLRP1Q9C000 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
NLRP1Q9C000 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NLRP1Q9C000 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NLRP1Q9C000 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NLRP1Q9C000 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NLRP1Q9C000 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NLRP1Q9C000 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NLRP1Q9C000 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NLRP1Q9C000 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NLRP1Q9C000 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NLRP1Q9C000 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NLRP1Q9C000 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NLRP1Q9C000 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
NLRP1Q9C000 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
NLRP1Q9C000 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
NLRP1Q9C000 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
NLRP1Q9C000 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
NLRP1Q9C000 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
NLRP1Q9C000 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.46
NLRP1Q9C000 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
NLRP1Q9C000 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
NLRP1Q9C000 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
NLRP1Q9C000 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.46
NLRP1Q9C000 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
NLRP1Q9C000 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
NLRP1Q9C000 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
NLRP1Q9C000 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
NLRP1Q9C000 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
NLRP1Q9C000 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
NLRP1Q9C000 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
NLRP1Q9C000 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
NLRP1Q9C000 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NLRP1Q9C000 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NLRP1Q9C000 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NLRP1Q9C000 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NLRP1Q9C000 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NLRP1Q9C000 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NLRP1Q9C000 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NLRP1Q9C000 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NLRP1Q9C000 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NLRP1Q9C000 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NLRP1Q9C000 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NLRP1Q9C000 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NLRP1Q9C000 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NLRP1Q9C000 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NLRP1Q9C000 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NLRP1Q9C000 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NLRP1Q9C000 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
NLRP1Q9C000 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NLRP1Q9C000 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NLRP1Q9C000 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NLRP1Q9C000 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NLRP1Q9C000 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NLRP1Q9C000 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NLRP1Q9C000 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NLRP1Q9C000 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NLRP1Q9C000 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NLRP1Q9C000 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NLRP1Q9C000 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NLRP1Q9C000 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NLRP1Q9C000 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NLRP1Q9C000 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NLRP1Q9C000 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NLRP1Q9C000 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NLRP1Q9C000 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
NLRP1Q9C000 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NLRP1Q9C000 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NLRP1Q9C000 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NLRP1Q9C000 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NLRP1Q9C000 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NLRP1Q9C000 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NLRP1Q9C000 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NLRP1Q9C000 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NLRP1Q9C000 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NLRP1Q9C000 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NLRP1Q9C000 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
NLRP1Q9C000 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms