Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY12

SCAPER, S phase cyclin A-associated protein in the endoplasmic reticulum, humanhuman

Predictions only

Length 1,400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAPERQ9BY12 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SCAPERQ9BY12 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SCAPERQ9BY12 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SCAPERQ9BY12 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SCAPERQ9BY12 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SCAPERQ9BY12 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SCAPERQ9BY12 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SCAPERQ9BY12 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SCAPERQ9BY12 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SCAPERQ9BY12 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SCAPERQ9BY12 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SCAPERQ9BY12 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SCAPERQ9BY12 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SCAPERQ9BY12 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SCAPERQ9BY12 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SCAPERQ9BY12 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SCAPERQ9BY12 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SCAPERQ9BY12 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SCAPERQ9BY12 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
SCAPERQ9BY12 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SCAPERQ9BY12 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SCAPERQ9BY12 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
SCAPERQ9BY12 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
SCAPERQ9BY12 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SCAPERQ9BY12 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SCAPERQ9BY12 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SCAPERQ9BY12 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SCAPERQ9BY12 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SCAPERQ9BY12 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SCAPERQ9BY12 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SCAPERQ9BY12 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SCAPERQ9BY12 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SCAPERQ9BY12 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SCAPERQ9BY12 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SCAPERQ9BY12 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SCAPERQ9BY12 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
SCAPERQ9BY12 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SCAPERQ9BY12 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SCAPERQ9BY12 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
SCAPERQ9BY12 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SCAPERQ9BY12 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SCAPERQ9BY12 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SCAPERQ9BY12 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SCAPERQ9BY12 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SCAPERQ9BY12 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SCAPERQ9BY12 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SCAPERQ9BY12 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SCAPERQ9BY12 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SCAPERQ9BY12 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SCAPERQ9BY12 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SCAPERQ9BY12 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SCAPERQ9BY12 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SCAPERQ9BY12 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
SCAPERQ9BY12 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
SCAPERQ9BY12 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SCAPERQ9BY12 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
SCAPERQ9BY12 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SCAPERQ9BY12 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SCAPERQ9BY12 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SCAPERQ9BY12 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SCAPERQ9BY12 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SCAPERQ9BY12 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SCAPERQ9BY12 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SCAPERQ9BY12 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SCAPERQ9BY12 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SCAPERQ9BY12 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SCAPERQ9BY12 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SCAPERQ9BY12 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SCAPERQ9BY12 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
SCAPERQ9BY12 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SCAPERQ9BY12 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SCAPERQ9BY12 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SCAPERQ9BY12 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
SCAPERQ9BY12 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SCAPERQ9BY12 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SCAPERQ9BY12 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SCAPERQ9BY12 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SCAPERQ9BY12 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SCAPERQ9BY12 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SCAPERQ9BY12 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SCAPERQ9BY12 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SCAPERQ9BY12 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SCAPERQ9BY12 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SCAPERQ9BY12 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
SCAPERQ9BY12 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SCAPERQ9BY12 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SCAPERQ9BY12 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SCAPERQ9BY12 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
SCAPERQ9BY12 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SCAPERQ9BY12 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SCAPERQ9BY12 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SCAPERQ9BY12 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SCAPERQ9BY12 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SCAPERQ9BY12 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SCAPERQ9BY12 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
SCAPERQ9BY12 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SCAPERQ9BY12 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SCAPERQ9BY12 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SCAPERQ9BY12 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SCAPERQ9BY12 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms