Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW3

SNHG12, Putative uncharacterized protein SNHG12, humanhuman

Predictions only

Length 62 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNHG12Q9BXW3 PDE1C-205ENST00000396191 2952 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
SNHG12Q9BXW3 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
SNHG12Q9BXW3 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
SNHG12Q9BXW3 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
SNHG12Q9BXW3 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
SNHG12Q9BXW3 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
SNHG12Q9BXW3 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC12.24□□□□□ -0.45
SNHG12Q9BXW3 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
SNHG12Q9BXW3 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
SNHG12Q9BXW3 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
SNHG12Q9BXW3 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
SNHG12Q9BXW3 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
SNHG12Q9BXW3 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
SNHG12Q9BXW3 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
SNHG12Q9BXW3 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
SNHG12Q9BXW3 PTPRN-201ENST00000295718 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
SNHG12Q9BXW3 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
SNHG12Q9BXW3 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
SNHG12Q9BXW3 RNH1-224ENST00000534797 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
SNHG12Q9BXW3 KDELR2-201ENST00000258739 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
SNHG12Q9BXW3 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
SNHG12Q9BXW3 SLC22A2-202ENST00000366953 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
SNHG12Q9BXW3 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
SNHG12Q9BXW3 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
SNHG12Q9BXW3 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
SNHG12Q9BXW3 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
SNHG12Q9BXW3 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
SNHG12Q9BXW3 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
SNHG12Q9BXW3 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
SNHG12Q9BXW3 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
SNHG12Q9BXW3 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
SNHG12Q9BXW3 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
SNHG12Q9BXW3 ZNF501-205ENST00000620116 3382 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.23□□□□□ -0.45
SNHG12Q9BXW3 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
SNHG12Q9BXW3 DKFZP434A062-201ENST00000573103 5021 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
SNHG12Q9BXW3 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
SNHG12Q9BXW3 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
SNHG12Q9BXW3 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
SNHG12Q9BXW3 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
SNHG12Q9BXW3 PRMT3-202ENST00000331079 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
SNHG12Q9BXW3 RSPO3-201ENST00000356698 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
SNHG12Q9BXW3 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
SNHG12Q9BXW3 SH3BP5L-201ENST00000366472 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
SNHG12Q9BXW3 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
SNHG12Q9BXW3 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
SNHG12Q9BXW3 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC12.23□□□□□ -0.45
SNHG12Q9BXW3 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
SNHG12Q9BXW3 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC12.23□□□□□ -0.45
SNHG12Q9BXW3 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
SNHG12Q9BXW3 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
SNHG12Q9BXW3 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
SNHG12Q9BXW3 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
SNHG12Q9BXW3 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
SNHG12Q9BXW3 GGT5-202ENST00000327365 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
SNHG12Q9BXW3 TP53I11-222ENST00000616990 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
SNHG12Q9BXW3 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
SNHG12Q9BXW3 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
SNHG12Q9BXW3 PPP6R2-203ENST00000395741 3304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
SNHG12Q9BXW3 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
SNHG12Q9BXW3 CHRNA3-201ENST00000326828 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
SNHG12Q9BXW3 PBXIP1-202ENST00000368463 3212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
SNHG12Q9BXW3 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
SNHG12Q9BXW3 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
SNHG12Q9BXW3 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
SNHG12Q9BXW3 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
SNHG12Q9BXW3 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
SNHG12Q9BXW3 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
SNHG12Q9BXW3 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
SNHG12Q9BXW3 CYB561-202ENST00000392975 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
SNHG12Q9BXW3 AKNA-204ENST00000374075 5038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
SNHG12Q9BXW3 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
SNHG12Q9BXW3 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
SNHG12Q9BXW3 PRSS16-203ENST00000421826 1949 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
SNHG12Q9BXW3 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
SNHG12Q9BXW3 NEFH-201ENST00000310624 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
SNHG12Q9BXW3 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
SNHG12Q9BXW3 FUT8-202ENST00000358307 2664 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
SNHG12Q9BXW3 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
SNHG12Q9BXW3 LINC02048-201ENST00000440556 1771 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
SNHG12Q9BXW3 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
SNHG12Q9BXW3 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
SNHG12Q9BXW3 PRDM16-206ENST00000511072 4282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
SNHG12Q9BXW3 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
SNHG12Q9BXW3 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
SNHG12Q9BXW3 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
SNHG12Q9BXW3 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
SNHG12Q9BXW3 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
SNHG12Q9BXW3 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
SNHG12Q9BXW3 TASP1-201ENST00000337743 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
SNHG12Q9BXW3 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
SNHG12Q9BXW3 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
SNHG12Q9BXW3 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
SNHG12Q9BXW3 ZNF655-212ENST00000424881 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
SNHG12Q9BXW3 AC087386.2-201ENST00000623212 4637 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
SNHG12Q9BXW3 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
SNHG12Q9BXW3 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
SNHG12Q9BXW3 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
SNHG12Q9BXW3 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
SNHG12Q9BXW3 GDPD5-201ENST00000336898 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
SNHG12Q9BXW3 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.4 ms