Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXE9

VN1R3, Vomeronasal type-1 receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VN1R3Q9BXE9 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
VN1R3Q9BXE9 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
VN1R3Q9BXE9 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
VN1R3Q9BXE9 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
VN1R3Q9BXE9 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
VN1R3Q9BXE9 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
VN1R3Q9BXE9 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
VN1R3Q9BXE9 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
VN1R3Q9BXE9 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
VN1R3Q9BXE9 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
VN1R3Q9BXE9 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
VN1R3Q9BXE9 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
VN1R3Q9BXE9 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
VN1R3Q9BXE9 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
VN1R3Q9BXE9 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
VN1R3Q9BXE9 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
VN1R3Q9BXE9 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
VN1R3Q9BXE9 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
VN1R3Q9BXE9 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
VN1R3Q9BXE9 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
VN1R3Q9BXE9 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
VN1R3Q9BXE9 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
VN1R3Q9BXE9 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
VN1R3Q9BXE9 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
VN1R3Q9BXE9 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
VN1R3Q9BXE9 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
VN1R3Q9BXE9 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
VN1R3Q9BXE9 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
VN1R3Q9BXE9 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
VN1R3Q9BXE9 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
VN1R3Q9BXE9 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
VN1R3Q9BXE9 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
VN1R3Q9BXE9 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
VN1R3Q9BXE9 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
VN1R3Q9BXE9 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
VN1R3Q9BXE9 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
VN1R3Q9BXE9 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
VN1R3Q9BXE9 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
VN1R3Q9BXE9 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
VN1R3Q9BXE9 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
VN1R3Q9BXE9 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
VN1R3Q9BXE9 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
VN1R3Q9BXE9 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
VN1R3Q9BXE9 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
VN1R3Q9BXE9 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
VN1R3Q9BXE9 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
VN1R3Q9BXE9 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
VN1R3Q9BXE9 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
VN1R3Q9BXE9 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
VN1R3Q9BXE9 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
VN1R3Q9BXE9 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
VN1R3Q9BXE9 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
VN1R3Q9BXE9 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
VN1R3Q9BXE9 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
VN1R3Q9BXE9 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
VN1R3Q9BXE9 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
VN1R3Q9BXE9 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
VN1R3Q9BXE9 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
VN1R3Q9BXE9 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
VN1R3Q9BXE9 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
VN1R3Q9BXE9 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
VN1R3Q9BXE9 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
VN1R3Q9BXE9 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
VN1R3Q9BXE9 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
VN1R3Q9BXE9 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
VN1R3Q9BXE9 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
VN1R3Q9BXE9 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
VN1R3Q9BXE9 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
VN1R3Q9BXE9 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
VN1R3Q9BXE9 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
VN1R3Q9BXE9 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
VN1R3Q9BXE9 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
VN1R3Q9BXE9 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
VN1R3Q9BXE9 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
VN1R3Q9BXE9 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
VN1R3Q9BXE9 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
VN1R3Q9BXE9 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
VN1R3Q9BXE9 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
VN1R3Q9BXE9 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
VN1R3Q9BXE9 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
VN1R3Q9BXE9 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
VN1R3Q9BXE9 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
VN1R3Q9BXE9 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
VN1R3Q9BXE9 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
VN1R3Q9BXE9 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
VN1R3Q9BXE9 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
VN1R3Q9BXE9 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
VN1R3Q9BXE9 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
VN1R3Q9BXE9 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
VN1R3Q9BXE9 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
VN1R3Q9BXE9 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
VN1R3Q9BXE9 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
VN1R3Q9BXE9 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
VN1R3Q9BXE9 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
VN1R3Q9BXE9 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
VN1R3Q9BXE9 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
VN1R3Q9BXE9 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
VN1R3Q9BXE9 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
VN1R3Q9BXE9 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
VN1R3Q9BXE9 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.1 ms