Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX63

BRIP1, Fanconi anemia group J protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRIP1Q9BX63 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
BRIP1Q9BX63 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
BRIP1Q9BX63 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
BRIP1Q9BX63 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
BRIP1Q9BX63 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
BRIP1Q9BX63 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
BRIP1Q9BX63 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
BRIP1Q9BX63 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
BRIP1Q9BX63 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
BRIP1Q9BX63 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
BRIP1Q9BX63 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
BRIP1Q9BX63 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
BRIP1Q9BX63 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
BRIP1Q9BX63 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
BRIP1Q9BX63 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC20.96■□□□□ 0.95
BRIP1Q9BX63 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
BRIP1Q9BX63 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
BRIP1Q9BX63 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
BRIP1Q9BX63 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
BRIP1Q9BX63 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
BRIP1Q9BX63 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
BRIP1Q9BX63 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
BRIP1Q9BX63 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
BRIP1Q9BX63 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
BRIP1Q9BX63 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
BRIP1Q9BX63 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
BRIP1Q9BX63 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
BRIP1Q9BX63 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
BRIP1Q9BX63 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
BRIP1Q9BX63 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
BRIP1Q9BX63 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
BRIP1Q9BX63 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
BRIP1Q9BX63 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
BRIP1Q9BX63 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
BRIP1Q9BX63 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
BRIP1Q9BX63 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
BRIP1Q9BX63 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
BRIP1Q9BX63 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
BRIP1Q9BX63 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
BRIP1Q9BX63 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
BRIP1Q9BX63 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
BRIP1Q9BX63 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
BRIP1Q9BX63 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
BRIP1Q9BX63 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
BRIP1Q9BX63 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
BRIP1Q9BX63 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
BRIP1Q9BX63 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
BRIP1Q9BX63 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
BRIP1Q9BX63 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
BRIP1Q9BX63 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
BRIP1Q9BX63 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC20.95■□□□□ 0.94
BRIP1Q9BX63 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
BRIP1Q9BX63 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
BRIP1Q9BX63 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
BRIP1Q9BX63 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
BRIP1Q9BX63 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
BRIP1Q9BX63 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
BRIP1Q9BX63 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
BRIP1Q9BX63 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
BRIP1Q9BX63 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
BRIP1Q9BX63 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
BRIP1Q9BX63 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
BRIP1Q9BX63 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
BRIP1Q9BX63 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
BRIP1Q9BX63 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC20.94■□□□□ 0.94
BRIP1Q9BX63 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
BRIP1Q9BX63 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
BRIP1Q9BX63 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
BRIP1Q9BX63 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
BRIP1Q9BX63 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
BRIP1Q9BX63 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
BRIP1Q9BX63 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
BRIP1Q9BX63 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
BRIP1Q9BX63 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
BRIP1Q9BX63 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
BRIP1Q9BX63 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
BRIP1Q9BX63 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
BRIP1Q9BX63 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
BRIP1Q9BX63 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
BRIP1Q9BX63 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
BRIP1Q9BX63 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
BRIP1Q9BX63 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
BRIP1Q9BX63 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
BRIP1Q9BX63 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
BRIP1Q9BX63 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
BRIP1Q9BX63 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
BRIP1Q9BX63 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
BRIP1Q9BX63 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
BRIP1Q9BX63 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
BRIP1Q9BX63 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
BRIP1Q9BX63 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
BRIP1Q9BX63 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
BRIP1Q9BX63 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
BRIP1Q9BX63 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
BRIP1Q9BX63 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
BRIP1Q9BX63 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
BRIP1Q9BX63 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
BRIP1Q9BX63 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
BRIP1Q9BX63 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
BRIP1Q9BX63 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms