Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW72

HIGD2A, HIG1 domain family member 2A, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIGD2AQ9BW72 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
HIGD2AQ9BW72 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
HIGD2AQ9BW72 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
HIGD2AQ9BW72 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
HIGD2AQ9BW72 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
HIGD2AQ9BW72 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
HIGD2AQ9BW72 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
HIGD2AQ9BW72 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
HIGD2AQ9BW72 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC10.9□□□□□ -0.66
HIGD2AQ9BW72 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
HIGD2AQ9BW72 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
HIGD2AQ9BW72 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
HIGD2AQ9BW72 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
HIGD2AQ9BW72 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC10.9□□□□□ -0.66
HIGD2AQ9BW72 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
HIGD2AQ9BW72 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
HIGD2AQ9BW72 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
HIGD2AQ9BW72 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
HIGD2AQ9BW72 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
HIGD2AQ9BW72 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
HIGD2AQ9BW72 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
HIGD2AQ9BW72 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
HIGD2AQ9BW72 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
HIGD2AQ9BW72 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
HIGD2AQ9BW72 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
HIGD2AQ9BW72 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
HIGD2AQ9BW72 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
HIGD2AQ9BW72 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
HIGD2AQ9BW72 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
HIGD2AQ9BW72 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
HIGD2AQ9BW72 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
HIGD2AQ9BW72 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
HIGD2AQ9BW72 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
HIGD2AQ9BW72 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
HIGD2AQ9BW72 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
HIGD2AQ9BW72 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
HIGD2AQ9BW72 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
HIGD2AQ9BW72 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
HIGD2AQ9BW72 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
HIGD2AQ9BW72 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
HIGD2AQ9BW72 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
HIGD2AQ9BW72 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
HIGD2AQ9BW72 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
HIGD2AQ9BW72 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
HIGD2AQ9BW72 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
HIGD2AQ9BW72 PLIN4-201ENST00000301286 6353 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
HIGD2AQ9BW72 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
HIGD2AQ9BW72 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC10.9□□□□□ -0.66
HIGD2AQ9BW72 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
HIGD2AQ9BW72 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
HIGD2AQ9BW72 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
HIGD2AQ9BW72 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
HIGD2AQ9BW72 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.67
HIGD2AQ9BW72 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
HIGD2AQ9BW72 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC10.9□□□□□ -0.67
HIGD2AQ9BW72 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
HIGD2AQ9BW72 PLIN4-202ENST00000633942 6484 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.67
HIGD2AQ9BW72 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.67
HIGD2AQ9BW72 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
HIGD2AQ9BW72 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
HIGD2AQ9BW72 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
HIGD2AQ9BW72 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
HIGD2AQ9BW72 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
HIGD2AQ9BW72 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
HIGD2AQ9BW72 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
HIGD2AQ9BW72 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
HIGD2AQ9BW72 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
HIGD2AQ9BW72 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
HIGD2AQ9BW72 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
HIGD2AQ9BW72 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
HIGD2AQ9BW72 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
HIGD2AQ9BW72 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
HIGD2AQ9BW72 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
HIGD2AQ9BW72 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
HIGD2AQ9BW72 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
HIGD2AQ9BW72 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
HIGD2AQ9BW72 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
HIGD2AQ9BW72 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
HIGD2AQ9BW72 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
HIGD2AQ9BW72 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
HIGD2AQ9BW72 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
HIGD2AQ9BW72 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
HIGD2AQ9BW72 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
HIGD2AQ9BW72 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
HIGD2AQ9BW72 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
HIGD2AQ9BW72 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
HIGD2AQ9BW72 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
HIGD2AQ9BW72 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
HIGD2AQ9BW72 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
HIGD2AQ9BW72 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
HIGD2AQ9BW72 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
HIGD2AQ9BW72 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
HIGD2AQ9BW72 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
HIGD2AQ9BW72 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
HIGD2AQ9BW72 HECW1-203ENST00000453890 5169 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
HIGD2AQ9BW72 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
HIGD2AQ9BW72 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
HIGD2AQ9BW72 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
HIGD2AQ9BW72 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
HIGD2AQ9BW72 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.3 ms