Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVL2

NUP58, Nucleoporin p58/p45, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP58Q9BVL2 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NUP58Q9BVL2 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NUP58Q9BVL2 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NUP58Q9BVL2 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
NUP58Q9BVL2 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
NUP58Q9BVL2 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
NUP58Q9BVL2 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NUP58Q9BVL2 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NUP58Q9BVL2 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NUP58Q9BVL2 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NUP58Q9BVL2 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NUP58Q9BVL2 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NUP58Q9BVL2 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
NUP58Q9BVL2 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
NUP58Q9BVL2 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NUP58Q9BVL2 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NUP58Q9BVL2 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
NUP58Q9BVL2 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NUP58Q9BVL2 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NUP58Q9BVL2 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NUP58Q9BVL2 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
NUP58Q9BVL2 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NUP58Q9BVL2 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
NUP58Q9BVL2 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NUP58Q9BVL2 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NUP58Q9BVL2 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
NUP58Q9BVL2 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
NUP58Q9BVL2 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
NUP58Q9BVL2 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
NUP58Q9BVL2 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
NUP58Q9BVL2 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NUP58Q9BVL2 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NUP58Q9BVL2 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NUP58Q9BVL2 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
NUP58Q9BVL2 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NUP58Q9BVL2 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NUP58Q9BVL2 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
NUP58Q9BVL2 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
NUP58Q9BVL2 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NUP58Q9BVL2 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
NUP58Q9BVL2 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NUP58Q9BVL2 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
NUP58Q9BVL2 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NUP58Q9BVL2 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
NUP58Q9BVL2 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NUP58Q9BVL2 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NUP58Q9BVL2 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
NUP58Q9BVL2 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
NUP58Q9BVL2 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
NUP58Q9BVL2 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NUP58Q9BVL2 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
NUP58Q9BVL2 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
NUP58Q9BVL2 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
NUP58Q9BVL2 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
NUP58Q9BVL2 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
NUP58Q9BVL2 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NUP58Q9BVL2 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NUP58Q9BVL2 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
NUP58Q9BVL2 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
NUP58Q9BVL2 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
NUP58Q9BVL2 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NUP58Q9BVL2 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NUP58Q9BVL2 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NUP58Q9BVL2 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
NUP58Q9BVL2 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
NUP58Q9BVL2 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NUP58Q9BVL2 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NUP58Q9BVL2 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
NUP58Q9BVL2 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NUP58Q9BVL2 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
NUP58Q9BVL2 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
NUP58Q9BVL2 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
NUP58Q9BVL2 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
NUP58Q9BVL2 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
NUP58Q9BVL2 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
NUP58Q9BVL2 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
NUP58Q9BVL2 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
NUP58Q9BVL2 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
NUP58Q9BVL2 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
NUP58Q9BVL2 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
NUP58Q9BVL2 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NUP58Q9BVL2 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
NUP58Q9BVL2 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NUP58Q9BVL2 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NUP58Q9BVL2 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NUP58Q9BVL2 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NUP58Q9BVL2 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NUP58Q9BVL2 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NUP58Q9BVL2 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
NUP58Q9BVL2 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
NUP58Q9BVL2 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
NUP58Q9BVL2 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
NUP58Q9BVL2 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
NUP58Q9BVL2 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
NUP58Q9BVL2 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
NUP58Q9BVL2 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NUP58Q9BVL2 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
NUP58Q9BVL2 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NUP58Q9BVL2 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
NUP58Q9BVL2 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms