Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSR8

YIPF4, Protein YIPF4, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YIPF4Q9BSR8 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
YIPF4Q9BSR8 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
YIPF4Q9BSR8 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
YIPF4Q9BSR8 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
YIPF4Q9BSR8 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
YIPF4Q9BSR8 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
YIPF4Q9BSR8 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
YIPF4Q9BSR8 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
YIPF4Q9BSR8 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
YIPF4Q9BSR8 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
YIPF4Q9BSR8 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
YIPF4Q9BSR8 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
YIPF4Q9BSR8 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
YIPF4Q9BSR8 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
YIPF4Q9BSR8 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
YIPF4Q9BSR8 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
YIPF4Q9BSR8 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
YIPF4Q9BSR8 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
YIPF4Q9BSR8 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
YIPF4Q9BSR8 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
YIPF4Q9BSR8 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
YIPF4Q9BSR8 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
YIPF4Q9BSR8 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
YIPF4Q9BSR8 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
YIPF4Q9BSR8 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
YIPF4Q9BSR8 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
YIPF4Q9BSR8 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
YIPF4Q9BSR8 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
YIPF4Q9BSR8 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
YIPF4Q9BSR8 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
YIPF4Q9BSR8 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
YIPF4Q9BSR8 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
YIPF4Q9BSR8 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
YIPF4Q9BSR8 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
YIPF4Q9BSR8 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
YIPF4Q9BSR8 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
YIPF4Q9BSR8 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
YIPF4Q9BSR8 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
YIPF4Q9BSR8 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
YIPF4Q9BSR8 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
YIPF4Q9BSR8 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
YIPF4Q9BSR8 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
YIPF4Q9BSR8 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
YIPF4Q9BSR8 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
YIPF4Q9BSR8 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
YIPF4Q9BSR8 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
YIPF4Q9BSR8 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
YIPF4Q9BSR8 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
YIPF4Q9BSR8 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
YIPF4Q9BSR8 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
YIPF4Q9BSR8 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
YIPF4Q9BSR8 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
YIPF4Q9BSR8 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
YIPF4Q9BSR8 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
YIPF4Q9BSR8 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
YIPF4Q9BSR8 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
YIPF4Q9BSR8 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
YIPF4Q9BSR8 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
YIPF4Q9BSR8 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
YIPF4Q9BSR8 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
YIPF4Q9BSR8 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
YIPF4Q9BSR8 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
YIPF4Q9BSR8 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
YIPF4Q9BSR8 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
YIPF4Q9BSR8 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
YIPF4Q9BSR8 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
YIPF4Q9BSR8 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
YIPF4Q9BSR8 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
YIPF4Q9BSR8 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
YIPF4Q9BSR8 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
YIPF4Q9BSR8 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
YIPF4Q9BSR8 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
YIPF4Q9BSR8 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
YIPF4Q9BSR8 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
YIPF4Q9BSR8 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
YIPF4Q9BSR8 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
YIPF4Q9BSR8 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
YIPF4Q9BSR8 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
YIPF4Q9BSR8 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
YIPF4Q9BSR8 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
YIPF4Q9BSR8 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
YIPF4Q9BSR8 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
YIPF4Q9BSR8 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
YIPF4Q9BSR8 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
YIPF4Q9BSR8 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
YIPF4Q9BSR8 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
YIPF4Q9BSR8 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
YIPF4Q9BSR8 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
YIPF4Q9BSR8 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
YIPF4Q9BSR8 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
YIPF4Q9BSR8 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
YIPF4Q9BSR8 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
YIPF4Q9BSR8 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
YIPF4Q9BSR8 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
YIPF4Q9BSR8 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
YIPF4Q9BSR8 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
YIPF4Q9BSR8 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
YIPF4Q9BSR8 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
YIPF4Q9BSR8 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
YIPF4Q9BSR8 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms