Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSA9

TMEM175, Endosomal/lysosomal potassium channel TMEM175, humanhuman

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM175Q9BSA9 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMEM175Q9BSA9 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMEM175Q9BSA9 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMEM175Q9BSA9 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMEM175Q9BSA9 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMEM175Q9BSA9 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMEM175Q9BSA9 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMEM175Q9BSA9 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
TMEM175Q9BSA9 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMEM175Q9BSA9 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMEM175Q9BSA9 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMEM175Q9BSA9 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMEM175Q9BSA9 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMEM175Q9BSA9 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
TMEM175Q9BSA9 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMEM175Q9BSA9 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
TMEM175Q9BSA9 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMEM175Q9BSA9 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMEM175Q9BSA9 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMEM175Q9BSA9 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMEM175Q9BSA9 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMEM175Q9BSA9 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMEM175Q9BSA9 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMEM175Q9BSA9 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMEM175Q9BSA9 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMEM175Q9BSA9 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMEM175Q9BSA9 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMEM175Q9BSA9 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
TMEM175Q9BSA9 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMEM175Q9BSA9 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMEM175Q9BSA9 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMEM175Q9BSA9 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMEM175Q9BSA9 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMEM175Q9BSA9 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMEM175Q9BSA9 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMEM175Q9BSA9 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMEM175Q9BSA9 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMEM175Q9BSA9 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMEM175Q9BSA9 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMEM175Q9BSA9 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMEM175Q9BSA9 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMEM175Q9BSA9 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMEM175Q9BSA9 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMEM175Q9BSA9 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMEM175Q9BSA9 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMEM175Q9BSA9 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
TMEM175Q9BSA9 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMEM175Q9BSA9 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
TMEM175Q9BSA9 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMEM175Q9BSA9 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
TMEM175Q9BSA9 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMEM175Q9BSA9 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMEM175Q9BSA9 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMEM175Q9BSA9 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMEM175Q9BSA9 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMEM175Q9BSA9 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMEM175Q9BSA9 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMEM175Q9BSA9 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMEM175Q9BSA9 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMEM175Q9BSA9 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMEM175Q9BSA9 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMEM175Q9BSA9 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMEM175Q9BSA9 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMEM175Q9BSA9 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMEM175Q9BSA9 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMEM175Q9BSA9 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMEM175Q9BSA9 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TMEM175Q9BSA9 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TMEM175Q9BSA9 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TMEM175Q9BSA9 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TMEM175Q9BSA9 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TMEM175Q9BSA9 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TMEM175Q9BSA9 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TMEM175Q9BSA9 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TMEM175Q9BSA9 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TMEM175Q9BSA9 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TMEM175Q9BSA9 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TMEM175Q9BSA9 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TMEM175Q9BSA9 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TMEM175Q9BSA9 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
TMEM175Q9BSA9 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
TMEM175Q9BSA9 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TMEM175Q9BSA9 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TMEM175Q9BSA9 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TMEM175Q9BSA9 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TMEM175Q9BSA9 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TMEM175Q9BSA9 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TMEM175Q9BSA9 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TMEM175Q9BSA9 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TMEM175Q9BSA9 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TMEM175Q9BSA9 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TMEM175Q9BSA9 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TMEM175Q9BSA9 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TMEM175Q9BSA9 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TMEM175Q9BSA9 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TMEM175Q9BSA9 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TMEM175Q9BSA9 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TMEM175Q9BSA9 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TMEM175Q9BSA9 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TMEM175Q9BSA9 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms