Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ16

SPOCK3, Testican-3, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCK3Q9BQ16 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SPOCK3Q9BQ16 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SPOCK3Q9BQ16 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SPOCK3Q9BQ16 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SPOCK3Q9BQ16 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SPOCK3Q9BQ16 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SPOCK3Q9BQ16 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SPOCK3Q9BQ16 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SPOCK3Q9BQ16 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SPOCK3Q9BQ16 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
SPOCK3Q9BQ16 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SPOCK3Q9BQ16 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
SPOCK3Q9BQ16 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SPOCK3Q9BQ16 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SPOCK3Q9BQ16 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
SPOCK3Q9BQ16 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SPOCK3Q9BQ16 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SPOCK3Q9BQ16 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SPOCK3Q9BQ16 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SPOCK3Q9BQ16 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SPOCK3Q9BQ16 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SPOCK3Q9BQ16 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SPOCK3Q9BQ16 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SPOCK3Q9BQ16 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SPOCK3Q9BQ16 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SPOCK3Q9BQ16 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SPOCK3Q9BQ16 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SPOCK3Q9BQ16 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SPOCK3Q9BQ16 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SPOCK3Q9BQ16 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SPOCK3Q9BQ16 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SPOCK3Q9BQ16 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SPOCK3Q9BQ16 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SPOCK3Q9BQ16 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SPOCK3Q9BQ16 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SPOCK3Q9BQ16 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
SPOCK3Q9BQ16 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SPOCK3Q9BQ16 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SPOCK3Q9BQ16 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SPOCK3Q9BQ16 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SPOCK3Q9BQ16 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SPOCK3Q9BQ16 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SPOCK3Q9BQ16 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SPOCK3Q9BQ16 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SPOCK3Q9BQ16 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SPOCK3Q9BQ16 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SPOCK3Q9BQ16 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SPOCK3Q9BQ16 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SPOCK3Q9BQ16 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
SPOCK3Q9BQ16 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SPOCK3Q9BQ16 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SPOCK3Q9BQ16 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SPOCK3Q9BQ16 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SPOCK3Q9BQ16 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
SPOCK3Q9BQ16 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SPOCK3Q9BQ16 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SPOCK3Q9BQ16 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SPOCK3Q9BQ16 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SPOCK3Q9BQ16 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SPOCK3Q9BQ16 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SPOCK3Q9BQ16 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SPOCK3Q9BQ16 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SPOCK3Q9BQ16 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SPOCK3Q9BQ16 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
SPOCK3Q9BQ16 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SPOCK3Q9BQ16 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
SPOCK3Q9BQ16 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SPOCK3Q9BQ16 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SPOCK3Q9BQ16 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SPOCK3Q9BQ16 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SPOCK3Q9BQ16 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SPOCK3Q9BQ16 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SPOCK3Q9BQ16 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SPOCK3Q9BQ16 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SPOCK3Q9BQ16 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SPOCK3Q9BQ16 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SPOCK3Q9BQ16 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SPOCK3Q9BQ16 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SPOCK3Q9BQ16 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SPOCK3Q9BQ16 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SPOCK3Q9BQ16 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SPOCK3Q9BQ16 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SPOCK3Q9BQ16 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SPOCK3Q9BQ16 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SPOCK3Q9BQ16 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SPOCK3Q9BQ16 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SPOCK3Q9BQ16 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SPOCK3Q9BQ16 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SPOCK3Q9BQ16 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SPOCK3Q9BQ16 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SPOCK3Q9BQ16 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SPOCK3Q9BQ16 DUSP10-201ENST00000366899 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SPOCK3Q9BQ16 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SPOCK3Q9BQ16 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SPOCK3Q9BQ16 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SPOCK3Q9BQ16 DCD-201ENST00000293371 645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SPOCK3Q9BQ16 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SPOCK3Q9BQ16 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SPOCK3Q9BQ16 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SPOCK3Q9BQ16 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.8 ms