Protein–RNA interactions for Protein: Q96S38

RPS6KC1, Ribosomal protein S6 kinase delta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KC1Q96S38 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RPS6KC1Q96S38 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RPS6KC1Q96S38 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RPS6KC1Q96S38 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RPS6KC1Q96S38 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RPS6KC1Q96S38 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RPS6KC1Q96S38 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RPS6KC1Q96S38 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RPS6KC1Q96S38 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RPS6KC1Q96S38 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RPS6KC1Q96S38 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RPS6KC1Q96S38 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RPS6KC1Q96S38 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RPS6KC1Q96S38 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RPS6KC1Q96S38 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RPS6KC1Q96S38 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RPS6KC1Q96S38 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RPS6KC1Q96S38 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RPS6KC1Q96S38 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RPS6KC1Q96S38 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RPS6KC1Q96S38 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RPS6KC1Q96S38 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RPS6KC1Q96S38 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RPS6KC1Q96S38 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RPS6KC1Q96S38 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RPS6KC1Q96S38 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RPS6KC1Q96S38 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
RPS6KC1Q96S38 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
RPS6KC1Q96S38 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RPS6KC1Q96S38 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RPS6KC1Q96S38 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RPS6KC1Q96S38 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RPS6KC1Q96S38 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RPS6KC1Q96S38 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
RPS6KC1Q96S38 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RPS6KC1Q96S38 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RPS6KC1Q96S38 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RPS6KC1Q96S38 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RPS6KC1Q96S38 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RPS6KC1Q96S38 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RPS6KC1Q96S38 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RPS6KC1Q96S38 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RPS6KC1Q96S38 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RPS6KC1Q96S38 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RPS6KC1Q96S38 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RPS6KC1Q96S38 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RPS6KC1Q96S38 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RPS6KC1Q96S38 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RPS6KC1Q96S38 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RPS6KC1Q96S38 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RPS6KC1Q96S38 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RPS6KC1Q96S38 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
RPS6KC1Q96S38 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RPS6KC1Q96S38 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RPS6KC1Q96S38 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RPS6KC1Q96S38 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RPS6KC1Q96S38 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RPS6KC1Q96S38 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RPS6KC1Q96S38 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RPS6KC1Q96S38 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RPS6KC1Q96S38 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RPS6KC1Q96S38 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RPS6KC1Q96S38 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RPS6KC1Q96S38 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RPS6KC1Q96S38 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RPS6KC1Q96S38 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RPS6KC1Q96S38 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RPS6KC1Q96S38 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RPS6KC1Q96S38 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RPS6KC1Q96S38 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RPS6KC1Q96S38 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RPS6KC1Q96S38 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RPS6KC1Q96S38 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
RPS6KC1Q96S38 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RPS6KC1Q96S38 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
RPS6KC1Q96S38 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RPS6KC1Q96S38 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RPS6KC1Q96S38 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RPS6KC1Q96S38 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RPS6KC1Q96S38 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RPS6KC1Q96S38 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RPS6KC1Q96S38 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RPS6KC1Q96S38 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.58
RPS6KC1Q96S38 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
RPS6KC1Q96S38 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RPS6KC1Q96S38 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RPS6KC1Q96S38 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RPS6KC1Q96S38 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RPS6KC1Q96S38 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RPS6KC1Q96S38 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RPS6KC1Q96S38 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RPS6KC1Q96S38 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RPS6KC1Q96S38 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RPS6KC1Q96S38 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RPS6KC1Q96S38 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RPS6KC1Q96S38 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RPS6KC1Q96S38 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RPS6KC1Q96S38 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RPS6KC1Q96S38 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RPS6KC1Q96S38 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms