Protein–RNA interactions for Protein: Q96RK0

CIC, Protein capicua homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,608 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CICQ96RK0 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CICQ96RK0 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CICQ96RK0 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CICQ96RK0 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CICQ96RK0 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CICQ96RK0 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CICQ96RK0 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CICQ96RK0 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CICQ96RK0 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CICQ96RK0 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CICQ96RK0 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CICQ96RK0 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
CICQ96RK0 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CICQ96RK0 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CICQ96RK0 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CICQ96RK0 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CICQ96RK0 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CICQ96RK0 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
CICQ96RK0 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
CICQ96RK0 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CICQ96RK0 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CICQ96RK0 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
CICQ96RK0 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CICQ96RK0 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CICQ96RK0 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CICQ96RK0 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CICQ96RK0 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CICQ96RK0 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CICQ96RK0 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
CICQ96RK0 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CICQ96RK0 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CICQ96RK0 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CICQ96RK0 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
CICQ96RK0 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
CICQ96RK0 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
CICQ96RK0 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
CICQ96RK0 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CICQ96RK0 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CICQ96RK0 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CICQ96RK0 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CICQ96RK0 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CICQ96RK0 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CICQ96RK0 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CICQ96RK0 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CICQ96RK0 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CICQ96RK0 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CICQ96RK0 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CICQ96RK0 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CICQ96RK0 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CICQ96RK0 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CICQ96RK0 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CICQ96RK0 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CICQ96RK0 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CICQ96RK0 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CICQ96RK0 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CICQ96RK0 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CICQ96RK0 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
CICQ96RK0 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CICQ96RK0 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CICQ96RK0 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CICQ96RK0 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CICQ96RK0 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CICQ96RK0 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CICQ96RK0 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CICQ96RK0 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CICQ96RK0 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CICQ96RK0 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CICQ96RK0 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CICQ96RK0 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CICQ96RK0 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CICQ96RK0 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CICQ96RK0 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CICQ96RK0 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CICQ96RK0 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CICQ96RK0 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CICQ96RK0 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
CICQ96RK0 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CICQ96RK0 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CICQ96RK0 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CICQ96RK0 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CICQ96RK0 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CICQ96RK0 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CICQ96RK0 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CICQ96RK0 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CICQ96RK0 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
CICQ96RK0 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CICQ96RK0 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CICQ96RK0 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CICQ96RK0 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CICQ96RK0 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CICQ96RK0 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CICQ96RK0 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
CICQ96RK0 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CICQ96RK0 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CICQ96RK0 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CICQ96RK0 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CICQ96RK0 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CICQ96RK0 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CICQ96RK0 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CICQ96RK0 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms