Protein–RNA interactions for Protein: Q96GS4

BORCS6, BLOC-1-related complex subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 357 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BORCS6Q96GS4 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
BORCS6Q96GS4 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
BORCS6Q96GS4 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
BORCS6Q96GS4 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
BORCS6Q96GS4 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
BORCS6Q96GS4 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
BORCS6Q96GS4 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
BORCS6Q96GS4 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
BORCS6Q96GS4 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
BORCS6Q96GS4 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
BORCS6Q96GS4 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
BORCS6Q96GS4 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
BORCS6Q96GS4 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
BORCS6Q96GS4 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
BORCS6Q96GS4 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
BORCS6Q96GS4 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
BORCS6Q96GS4 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
BORCS6Q96GS4 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
BORCS6Q96GS4 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
BORCS6Q96GS4 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
BORCS6Q96GS4 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
BORCS6Q96GS4 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
BORCS6Q96GS4 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
BORCS6Q96GS4 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
BORCS6Q96GS4 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
BORCS6Q96GS4 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
BORCS6Q96GS4 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
BORCS6Q96GS4 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
BORCS6Q96GS4 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
BORCS6Q96GS4 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
BORCS6Q96GS4 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
BORCS6Q96GS4 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
BORCS6Q96GS4 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
BORCS6Q96GS4 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
BORCS6Q96GS4 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
BORCS6Q96GS4 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
BORCS6Q96GS4 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
BORCS6Q96GS4 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
BORCS6Q96GS4 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
BORCS6Q96GS4 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
BORCS6Q96GS4 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
BORCS6Q96GS4 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
BORCS6Q96GS4 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
BORCS6Q96GS4 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
BORCS6Q96GS4 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
BORCS6Q96GS4 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
BORCS6Q96GS4 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
BORCS6Q96GS4 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
BORCS6Q96GS4 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
BORCS6Q96GS4 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
BORCS6Q96GS4 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
BORCS6Q96GS4 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
BORCS6Q96GS4 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
BORCS6Q96GS4 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
BORCS6Q96GS4 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
BORCS6Q96GS4 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
BORCS6Q96GS4 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
BORCS6Q96GS4 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
BORCS6Q96GS4 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
BORCS6Q96GS4 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
BORCS6Q96GS4 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
BORCS6Q96GS4 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
BORCS6Q96GS4 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
BORCS6Q96GS4 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
BORCS6Q96GS4 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
BORCS6Q96GS4 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
BORCS6Q96GS4 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
BORCS6Q96GS4 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
BORCS6Q96GS4 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
BORCS6Q96GS4 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
BORCS6Q96GS4 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
BORCS6Q96GS4 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
BORCS6Q96GS4 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
BORCS6Q96GS4 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
BORCS6Q96GS4 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
BORCS6Q96GS4 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
BORCS6Q96GS4 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
BORCS6Q96GS4 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
BORCS6Q96GS4 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
BORCS6Q96GS4 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
BORCS6Q96GS4 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
BORCS6Q96GS4 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
BORCS6Q96GS4 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
BORCS6Q96GS4 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
BORCS6Q96GS4 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
BORCS6Q96GS4 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
BORCS6Q96GS4 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
BORCS6Q96GS4 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
BORCS6Q96GS4 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
BORCS6Q96GS4 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
BORCS6Q96GS4 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
BORCS6Q96GS4 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
BORCS6Q96GS4 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
BORCS6Q96GS4 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
BORCS6Q96GS4 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
BORCS6Q96GS4 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
BORCS6Q96GS4 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
BORCS6Q96GS4 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
BORCS6Q96GS4 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
BORCS6Q96GS4 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms