Protein–RNA interactions for Protein: Q96GP6

SCARF2, Scavenger receptor class F member 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 870 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARF2Q96GP6 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SCARF2Q96GP6 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SCARF2Q96GP6 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SCARF2Q96GP6 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SCARF2Q96GP6 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SCARF2Q96GP6 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SCARF2Q96GP6 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SCARF2Q96GP6 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SCARF2Q96GP6 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SCARF2Q96GP6 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SCARF2Q96GP6 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SCARF2Q96GP6 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SCARF2Q96GP6 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SCARF2Q96GP6 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SCARF2Q96GP6 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SCARF2Q96GP6 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SCARF2Q96GP6 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SCARF2Q96GP6 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SCARF2Q96GP6 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SCARF2Q96GP6 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SCARF2Q96GP6 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SCARF2Q96GP6 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SCARF2Q96GP6 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SCARF2Q96GP6 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SCARF2Q96GP6 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SCARF2Q96GP6 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SCARF2Q96GP6 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SCARF2Q96GP6 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SCARF2Q96GP6 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SCARF2Q96GP6 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SCARF2Q96GP6 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SCARF2Q96GP6 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SCARF2Q96GP6 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SCARF2Q96GP6 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SCARF2Q96GP6 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SCARF2Q96GP6 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SCARF2Q96GP6 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SCARF2Q96GP6 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SCARF2Q96GP6 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SCARF2Q96GP6 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SCARF2Q96GP6 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SCARF2Q96GP6 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SCARF2Q96GP6 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SCARF2Q96GP6 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SCARF2Q96GP6 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SCARF2Q96GP6 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SCARF2Q96GP6 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SCARF2Q96GP6 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SCARF2Q96GP6 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SCARF2Q96GP6 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SCARF2Q96GP6 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SCARF2Q96GP6 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SCARF2Q96GP6 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SCARF2Q96GP6 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SCARF2Q96GP6 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SCARF2Q96GP6 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SCARF2Q96GP6 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SCARF2Q96GP6 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SCARF2Q96GP6 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SCARF2Q96GP6 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SCARF2Q96GP6 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SCARF2Q96GP6 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SCARF2Q96GP6 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SCARF2Q96GP6 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SCARF2Q96GP6 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SCARF2Q96GP6 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
SCARF2Q96GP6 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SCARF2Q96GP6 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SCARF2Q96GP6 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SCARF2Q96GP6 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SCARF2Q96GP6 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SCARF2Q96GP6 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SCARF2Q96GP6 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SCARF2Q96GP6 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
SCARF2Q96GP6 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
SCARF2Q96GP6 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
SCARF2Q96GP6 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
SCARF2Q96GP6 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SCARF2Q96GP6 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SCARF2Q96GP6 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SCARF2Q96GP6 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SCARF2Q96GP6 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SCARF2Q96GP6 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SCARF2Q96GP6 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SCARF2Q96GP6 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SCARF2Q96GP6 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SCARF2Q96GP6 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SCARF2Q96GP6 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SCARF2Q96GP6 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SCARF2Q96GP6 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SCARF2Q96GP6 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SCARF2Q96GP6 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SCARF2Q96GP6 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SCARF2Q96GP6 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SCARF2Q96GP6 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SCARF2Q96GP6 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SCARF2Q96GP6 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SCARF2Q96GP6 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SCARF2Q96GP6 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SCARF2Q96GP6 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms