Protein–RNA interactions for Protein: Q96FQ7

LINC00526, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00526, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00526Q96FQ7 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC00526Q96FQ7 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC00526Q96FQ7 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC00526Q96FQ7 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC00526Q96FQ7 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC00526Q96FQ7 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC00526Q96FQ7 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC00526Q96FQ7 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC00526Q96FQ7 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC00526Q96FQ7 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC00526Q96FQ7 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC00526Q96FQ7 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC00526Q96FQ7 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC00526Q96FQ7 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC00526Q96FQ7 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC00526Q96FQ7 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC00526Q96FQ7 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC00526Q96FQ7 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC00526Q96FQ7 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC00526Q96FQ7 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC00526Q96FQ7 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC00526Q96FQ7 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC00526Q96FQ7 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC00526Q96FQ7 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC00526Q96FQ7 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC00526Q96FQ7 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC00526Q96FQ7 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC00526Q96FQ7 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC00526Q96FQ7 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC00526Q96FQ7 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC00526Q96FQ7 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC00526Q96FQ7 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC00526Q96FQ7 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC00526Q96FQ7 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC00526Q96FQ7 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC00526Q96FQ7 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC00526Q96FQ7 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC00526Q96FQ7 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC00526Q96FQ7 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC00526Q96FQ7 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC00526Q96FQ7 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC00526Q96FQ7 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC00526Q96FQ7 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC00526Q96FQ7 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC00526Q96FQ7 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC00526Q96FQ7 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC00526Q96FQ7 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC00526Q96FQ7 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC00526Q96FQ7 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC00526Q96FQ7 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC00526Q96FQ7 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC00526Q96FQ7 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC00526Q96FQ7 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC00526Q96FQ7 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC00526Q96FQ7 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC00526Q96FQ7 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC00526Q96FQ7 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC00526Q96FQ7 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC00526Q96FQ7 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC00526Q96FQ7 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC00526Q96FQ7 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC00526Q96FQ7 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC00526Q96FQ7 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC00526Q96FQ7 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC00526Q96FQ7 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC00526Q96FQ7 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC00526Q96FQ7 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC00526Q96FQ7 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC00526Q96FQ7 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC00526Q96FQ7 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC00526Q96FQ7 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC00526Q96FQ7 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC00526Q96FQ7 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC00526Q96FQ7 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC00526Q96FQ7 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC00526Q96FQ7 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC00526Q96FQ7 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC00526Q96FQ7 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC00526Q96FQ7 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC00526Q96FQ7 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC00526Q96FQ7 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC00526Q96FQ7 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC00526Q96FQ7 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC00526Q96FQ7 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC00526Q96FQ7 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC00526Q96FQ7 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC00526Q96FQ7 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC00526Q96FQ7 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC00526Q96FQ7 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC00526Q96FQ7 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC00526Q96FQ7 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC00526Q96FQ7 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC00526Q96FQ7 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC00526Q96FQ7 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC00526Q96FQ7 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC00526Q96FQ7 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC00526Q96FQ7 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC00526Q96FQ7 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC00526Q96FQ7 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC00526Q96FQ7 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.7 ms