Protein–RNA interactions for Protein: Q96CS3

FAF2, FAS-associated factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAF2Q96CS3 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FAF2Q96CS3 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FAF2Q96CS3 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
FAF2Q96CS3 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FAF2Q96CS3 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
FAF2Q96CS3 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
FAF2Q96CS3 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
FAF2Q96CS3 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
FAF2Q96CS3 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
FAF2Q96CS3 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
FAF2Q96CS3 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
FAF2Q96CS3 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
FAF2Q96CS3 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
FAF2Q96CS3 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
FAF2Q96CS3 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
FAF2Q96CS3 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
FAF2Q96CS3 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
FAF2Q96CS3 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
FAF2Q96CS3 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
FAF2Q96CS3 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
FAF2Q96CS3 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
FAF2Q96CS3 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
FAF2Q96CS3 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
FAF2Q96CS3 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
FAF2Q96CS3 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
FAF2Q96CS3 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
FAF2Q96CS3 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
FAF2Q96CS3 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
FAF2Q96CS3 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
FAF2Q96CS3 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
FAF2Q96CS3 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
FAF2Q96CS3 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
FAF2Q96CS3 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
FAF2Q96CS3 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
FAF2Q96CS3 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
FAF2Q96CS3 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
FAF2Q96CS3 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
FAF2Q96CS3 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
FAF2Q96CS3 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
FAF2Q96CS3 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
FAF2Q96CS3 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
FAF2Q96CS3 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
FAF2Q96CS3 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
FAF2Q96CS3 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
FAF2Q96CS3 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
FAF2Q96CS3 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
FAF2Q96CS3 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
FAF2Q96CS3 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
FAF2Q96CS3 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
FAF2Q96CS3 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
FAF2Q96CS3 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
FAF2Q96CS3 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
FAF2Q96CS3 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
FAF2Q96CS3 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
FAF2Q96CS3 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
FAF2Q96CS3 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
FAF2Q96CS3 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
FAF2Q96CS3 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
FAF2Q96CS3 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
FAF2Q96CS3 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
FAF2Q96CS3 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
FAF2Q96CS3 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
FAF2Q96CS3 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
FAF2Q96CS3 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
FAF2Q96CS3 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
FAF2Q96CS3 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
FAF2Q96CS3 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
FAF2Q96CS3 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
FAF2Q96CS3 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
FAF2Q96CS3 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
FAF2Q96CS3 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
FAF2Q96CS3 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
FAF2Q96CS3 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
FAF2Q96CS3 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
FAF2Q96CS3 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
FAF2Q96CS3 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
FAF2Q96CS3 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
FAF2Q96CS3 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
FAF2Q96CS3 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
FAF2Q96CS3 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
FAF2Q96CS3 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FAF2Q96CS3 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FAF2Q96CS3 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FAF2Q96CS3 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FAF2Q96CS3 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FAF2Q96CS3 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
FAF2Q96CS3 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FAF2Q96CS3 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FAF2Q96CS3 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FAF2Q96CS3 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FAF2Q96CS3 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
FAF2Q96CS3 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
FAF2Q96CS3 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FAF2Q96CS3 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
FAF2Q96CS3 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
FAF2Q96CS3 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FAF2Q96CS3 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
FAF2Q96CS3 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
FAF2Q96CS3 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FAF2Q96CS3 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms