Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXC6

COPS9, COP9 signalosome complex subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 57 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS9Q8WXC6 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
COPS9Q8WXC6 SPTBN2-209ENST00000533211 8128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
COPS9Q8WXC6 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
COPS9Q8WXC6 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
COPS9Q8WXC6 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
COPS9Q8WXC6 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
COPS9Q8WXC6 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
COPS9Q8WXC6 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
COPS9Q8WXC6 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
COPS9Q8WXC6 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
COPS9Q8WXC6 SESN3-203ENST00000536441 9558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
COPS9Q8WXC6 CELSR1-201ENST00000262738 11389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
COPS9Q8WXC6 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
COPS9Q8WXC6 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
COPS9Q8WXC6 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
COPS9Q8WXC6 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
COPS9Q8WXC6 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
COPS9Q8WXC6 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
COPS9Q8WXC6 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
COPS9Q8WXC6 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
COPS9Q8WXC6 NAA15-202ENST00000398947 6072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
COPS9Q8WXC6 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
COPS9Q8WXC6 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
COPS9Q8WXC6 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
COPS9Q8WXC6 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
COPS9Q8WXC6 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
COPS9Q8WXC6 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
COPS9Q8WXC6 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
COPS9Q8WXC6 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
COPS9Q8WXC6 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
COPS9Q8WXC6 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
COPS9Q8WXC6 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
COPS9Q8WXC6 DISC1-222ENST00000622252 6927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
COPS9Q8WXC6 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
COPS9Q8WXC6 RGS12-204ENST00000382788 5512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
COPS9Q8WXC6 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
COPS9Q8WXC6 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
COPS9Q8WXC6 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
COPS9Q8WXC6 NRXN1-210ENST00000406316 9375 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
COPS9Q8WXC6 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
COPS9Q8WXC6 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
COPS9Q8WXC6 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
COPS9Q8WXC6 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
COPS9Q8WXC6 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
COPS9Q8WXC6 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
COPS9Q8WXC6 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
COPS9Q8WXC6 DIAPH2-201ENST00000324765 9333 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
COPS9Q8WXC6 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
COPS9Q8WXC6 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
COPS9Q8WXC6 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
COPS9Q8WXC6 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
COPS9Q8WXC6 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
COPS9Q8WXC6 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
COPS9Q8WXC6 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
COPS9Q8WXC6 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
COPS9Q8WXC6 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
COPS9Q8WXC6 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
COPS9Q8WXC6 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
COPS9Q8WXC6 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
COPS9Q8WXC6 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
COPS9Q8WXC6 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
COPS9Q8WXC6 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC11.56□□□□□ -0.56
COPS9Q8WXC6 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
COPS9Q8WXC6 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
COPS9Q8WXC6 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
COPS9Q8WXC6 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
COPS9Q8WXC6 NEK9-201ENST00000238616 8310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
COPS9Q8WXC6 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
COPS9Q8WXC6 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
COPS9Q8WXC6 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
COPS9Q8WXC6 ARHGAP35-206ENST00000614079 7696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
COPS9Q8WXC6 SUGP2-203ENST00000452918 6176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
COPS9Q8WXC6 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
COPS9Q8WXC6 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
COPS9Q8WXC6 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
COPS9Q8WXC6 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
COPS9Q8WXC6 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
COPS9Q8WXC6 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
COPS9Q8WXC6 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
COPS9Q8WXC6 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
COPS9Q8WXC6 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
COPS9Q8WXC6 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
COPS9Q8WXC6 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
COPS9Q8WXC6 ANTXR2-203ENST00000403729 8273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
COPS9Q8WXC6 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
COPS9Q8WXC6 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
COPS9Q8WXC6 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
COPS9Q8WXC6 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
COPS9Q8WXC6 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
COPS9Q8WXC6 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
COPS9Q8WXC6 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
COPS9Q8WXC6 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
COPS9Q8WXC6 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
COPS9Q8WXC6 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
COPS9Q8WXC6 DDX31-204ENST00000372159 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
COPS9Q8WXC6 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
COPS9Q8WXC6 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
COPS9Q8WXC6 AMOTL2-201ENST00000249883 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
COPS9Q8WXC6 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
COPS9Q8WXC6 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms