Protein–RNA interactions for Protein: Q8TD22

SFXN5, Sideroflexin-5, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFXN5Q8TD22 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SFXN5Q8TD22 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SFXN5Q8TD22 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SFXN5Q8TD22 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SFXN5Q8TD22 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SFXN5Q8TD22 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SFXN5Q8TD22 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SFXN5Q8TD22 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SFXN5Q8TD22 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SFXN5Q8TD22 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SFXN5Q8TD22 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SFXN5Q8TD22 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SFXN5Q8TD22 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SFXN5Q8TD22 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SFXN5Q8TD22 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SFXN5Q8TD22 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SFXN5Q8TD22 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SFXN5Q8TD22 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SFXN5Q8TD22 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SFXN5Q8TD22 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SFXN5Q8TD22 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SFXN5Q8TD22 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SFXN5Q8TD22 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SFXN5Q8TD22 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SFXN5Q8TD22 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SFXN5Q8TD22 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SFXN5Q8TD22 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SFXN5Q8TD22 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SFXN5Q8TD22 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SFXN5Q8TD22 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SFXN5Q8TD22 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SFXN5Q8TD22 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SFXN5Q8TD22 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SFXN5Q8TD22 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SFXN5Q8TD22 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SFXN5Q8TD22 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SFXN5Q8TD22 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SFXN5Q8TD22 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SFXN5Q8TD22 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SFXN5Q8TD22 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SFXN5Q8TD22 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SFXN5Q8TD22 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SFXN5Q8TD22 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SFXN5Q8TD22 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SFXN5Q8TD22 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SFXN5Q8TD22 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SFXN5Q8TD22 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SFXN5Q8TD22 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SFXN5Q8TD22 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SFXN5Q8TD22 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SFXN5Q8TD22 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SFXN5Q8TD22 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SFXN5Q8TD22 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SFXN5Q8TD22 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SFXN5Q8TD22 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SFXN5Q8TD22 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SFXN5Q8TD22 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SFXN5Q8TD22 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SFXN5Q8TD22 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SFXN5Q8TD22 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SFXN5Q8TD22 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SFXN5Q8TD22 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SFXN5Q8TD22 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SFXN5Q8TD22 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SFXN5Q8TD22 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SFXN5Q8TD22 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SFXN5Q8TD22 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SFXN5Q8TD22 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SFXN5Q8TD22 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SFXN5Q8TD22 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SFXN5Q8TD22 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SFXN5Q8TD22 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SFXN5Q8TD22 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SFXN5Q8TD22 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SFXN5Q8TD22 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SFXN5Q8TD22 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SFXN5Q8TD22 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SFXN5Q8TD22 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SFXN5Q8TD22 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SFXN5Q8TD22 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SFXN5Q8TD22 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SFXN5Q8TD22 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SFXN5Q8TD22 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SFXN5Q8TD22 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SFXN5Q8TD22 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SFXN5Q8TD22 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SFXN5Q8TD22 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SFXN5Q8TD22 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SFXN5Q8TD22 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SFXN5Q8TD22 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SFXN5Q8TD22 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SFXN5Q8TD22 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SFXN5Q8TD22 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SFXN5Q8TD22 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SFXN5Q8TD22 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SFXN5Q8TD22 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SFXN5Q8TD22 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SFXN5Q8TD22 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SFXN5Q8TD22 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SFXN5Q8TD22 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.8 ms