Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6C5

IGSF1, Immunoglobulin superfamily member 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF1Q8N6C5 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
IGSF1Q8N6C5 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
IGSF1Q8N6C5 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
IGSF1Q8N6C5 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
IGSF1Q8N6C5 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
IGSF1Q8N6C5 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
IGSF1Q8N6C5 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
IGSF1Q8N6C5 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
IGSF1Q8N6C5 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
IGSF1Q8N6C5 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
IGSF1Q8N6C5 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
IGSF1Q8N6C5 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
IGSF1Q8N6C5 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
IGSF1Q8N6C5 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
IGSF1Q8N6C5 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
IGSF1Q8N6C5 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
IGSF1Q8N6C5 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
IGSF1Q8N6C5 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
IGSF1Q8N6C5 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
IGSF1Q8N6C5 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
IGSF1Q8N6C5 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
IGSF1Q8N6C5 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
IGSF1Q8N6C5 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
IGSF1Q8N6C5 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
IGSF1Q8N6C5 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
IGSF1Q8N6C5 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
IGSF1Q8N6C5 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
IGSF1Q8N6C5 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
IGSF1Q8N6C5 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
IGSF1Q8N6C5 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
IGSF1Q8N6C5 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
IGSF1Q8N6C5 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
IGSF1Q8N6C5 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
IGSF1Q8N6C5 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
IGSF1Q8N6C5 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
IGSF1Q8N6C5 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
IGSF1Q8N6C5 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
IGSF1Q8N6C5 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
IGSF1Q8N6C5 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
IGSF1Q8N6C5 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
IGSF1Q8N6C5 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
IGSF1Q8N6C5 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
IGSF1Q8N6C5 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
IGSF1Q8N6C5 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
IGSF1Q8N6C5 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
IGSF1Q8N6C5 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
IGSF1Q8N6C5 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
IGSF1Q8N6C5 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
IGSF1Q8N6C5 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
IGSF1Q8N6C5 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
IGSF1Q8N6C5 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
IGSF1Q8N6C5 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
IGSF1Q8N6C5 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
IGSF1Q8N6C5 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
IGSF1Q8N6C5 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
IGSF1Q8N6C5 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
IGSF1Q8N6C5 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
IGSF1Q8N6C5 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
IGSF1Q8N6C5 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
IGSF1Q8N6C5 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
IGSF1Q8N6C5 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
IGSF1Q8N6C5 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
IGSF1Q8N6C5 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
IGSF1Q8N6C5 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
IGSF1Q8N6C5 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
IGSF1Q8N6C5 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
IGSF1Q8N6C5 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
IGSF1Q8N6C5 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
IGSF1Q8N6C5 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
IGSF1Q8N6C5 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
IGSF1Q8N6C5 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
IGSF1Q8N6C5 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
IGSF1Q8N6C5 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
IGSF1Q8N6C5 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
IGSF1Q8N6C5 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
IGSF1Q8N6C5 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
IGSF1Q8N6C5 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
IGSF1Q8N6C5 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
IGSF1Q8N6C5 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
IGSF1Q8N6C5 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
IGSF1Q8N6C5 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
IGSF1Q8N6C5 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
IGSF1Q8N6C5 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
IGSF1Q8N6C5 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
IGSF1Q8N6C5 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
IGSF1Q8N6C5 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
IGSF1Q8N6C5 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
IGSF1Q8N6C5 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
IGSF1Q8N6C5 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
IGSF1Q8N6C5 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
IGSF1Q8N6C5 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
IGSF1Q8N6C5 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
IGSF1Q8N6C5 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
IGSF1Q8N6C5 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC22.2■■□□□ 1.15
IGSF1Q8N6C5 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
IGSF1Q8N6C5 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
IGSF1Q8N6C5 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
IGSF1Q8N6C5 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
IGSF1Q8N6C5 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
IGSF1Q8N6C5 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms