Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3C7

CLIP4, CAP-Gly domain-containing linker protein 4, humanhuman

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Length 705 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP4Q8N3C7 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CLIP4Q8N3C7 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLIP4Q8N3C7 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLIP4Q8N3C7 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLIP4Q8N3C7 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLIP4Q8N3C7 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLIP4Q8N3C7 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLIP4Q8N3C7 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLIP4Q8N3C7 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CLIP4Q8N3C7 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLIP4Q8N3C7 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLIP4Q8N3C7 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLIP4Q8N3C7 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLIP4Q8N3C7 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLIP4Q8N3C7 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLIP4Q8N3C7 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLIP4Q8N3C7 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CLIP4Q8N3C7 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLIP4Q8N3C7 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLIP4Q8N3C7 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLIP4Q8N3C7 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLIP4Q8N3C7 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLIP4Q8N3C7 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLIP4Q8N3C7 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLIP4Q8N3C7 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLIP4Q8N3C7 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CLIP4Q8N3C7 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLIP4Q8N3C7 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLIP4Q8N3C7 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLIP4Q8N3C7 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLIP4Q8N3C7 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLIP4Q8N3C7 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLIP4Q8N3C7 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLIP4Q8N3C7 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLIP4Q8N3C7 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLIP4Q8N3C7 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLIP4Q8N3C7 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLIP4Q8N3C7 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLIP4Q8N3C7 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLIP4Q8N3C7 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CLIP4Q8N3C7 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLIP4Q8N3C7 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLIP4Q8N3C7 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLIP4Q8N3C7 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CLIP4Q8N3C7 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLIP4Q8N3C7 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLIP4Q8N3C7 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLIP4Q8N3C7 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLIP4Q8N3C7 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLIP4Q8N3C7 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLIP4Q8N3C7 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLIP4Q8N3C7 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLIP4Q8N3C7 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLIP4Q8N3C7 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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CLIP4Q8N3C7 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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CLIP4Q8N3C7 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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CLIP4Q8N3C7 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLIP4Q8N3C7 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLIP4Q8N3C7 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLIP4Q8N3C7 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLIP4Q8N3C7 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
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CLIP4Q8N3C7 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLIP4Q8N3C7 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLIP4Q8N3C7 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLIP4Q8N3C7 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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CLIP4Q8N3C7 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLIP4Q8N3C7 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLIP4Q8N3C7 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLIP4Q8N3C7 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
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CLIP4Q8N3C7 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CLIP4Q8N3C7 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLIP4Q8N3C7 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLIP4Q8N3C7 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLIP4Q8N3C7 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLIP4Q8N3C7 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLIP4Q8N3C7 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLIP4Q8N3C7 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLIP4Q8N3C7 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLIP4Q8N3C7 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLIP4Q8N3C7 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLIP4Q8N3C7 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLIP4Q8N3C7 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CLIP4Q8N3C7 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLIP4Q8N3C7 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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