Protein–RNA interactions for Protein: Q702N8

XIRP1, Xin actin-binding repeat-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,843 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XIRP1Q702N8 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
XIRP1Q702N8 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
XIRP1Q702N8 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
XIRP1Q702N8 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
XIRP1Q702N8 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
XIRP1Q702N8 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
XIRP1Q702N8 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
XIRP1Q702N8 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
XIRP1Q702N8 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
XIRP1Q702N8 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
XIRP1Q702N8 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
XIRP1Q702N8 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
XIRP1Q702N8 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
XIRP1Q702N8 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
XIRP1Q702N8 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
XIRP1Q702N8 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
XIRP1Q702N8 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
XIRP1Q702N8 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
XIRP1Q702N8 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
XIRP1Q702N8 LINC01233-203ENST00000601708 494 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
XIRP1Q702N8 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
XIRP1Q702N8 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
XIRP1Q702N8 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
XIRP1Q702N8 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
XIRP1Q702N8 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
XIRP1Q702N8 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
XIRP1Q702N8 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
XIRP1Q702N8 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
XIRP1Q702N8 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
XIRP1Q702N8 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
XIRP1Q702N8 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
XIRP1Q702N8 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
XIRP1Q702N8 ZNF527-203ENST00000483919 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
XIRP1Q702N8 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
XIRP1Q702N8 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
XIRP1Q702N8 PPA1-206ENST00000625364 644 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
XIRP1Q702N8 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
XIRP1Q702N8 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
XIRP1Q702N8 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
XIRP1Q702N8 HMBS-216ENST00000543090 1347 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
XIRP1Q702N8 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
XIRP1Q702N8 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
XIRP1Q702N8 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
XIRP1Q702N8 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
XIRP1Q702N8 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
XIRP1Q702N8 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
XIRP1Q702N8 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
XIRP1Q702N8 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
XIRP1Q702N8 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
XIRP1Q702N8 LINC02205-201ENST00000559752 239 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
XIRP1Q702N8 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
XIRP1Q702N8 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
XIRP1Q702N8 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
XIRP1Q702N8 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
XIRP1Q702N8 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
XIRP1Q702N8 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
XIRP1Q702N8 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
XIRP1Q702N8 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
XIRP1Q702N8 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
XIRP1Q702N8 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
XIRP1Q702N8 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
XIRP1Q702N8 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
XIRP1Q702N8 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
XIRP1Q702N8 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
XIRP1Q702N8 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
XIRP1Q702N8 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
XIRP1Q702N8 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
XIRP1Q702N8 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
XIRP1Q702N8 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
XIRP1Q702N8 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
XIRP1Q702N8 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
XIRP1Q702N8 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
XIRP1Q702N8 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
XIRP1Q702N8 ELK2AP-201ENST00000392510 1007 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
XIRP1Q702N8 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
XIRP1Q702N8 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
XIRP1Q702N8 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
XIRP1Q702N8 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
XIRP1Q702N8 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
XIRP1Q702N8 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
XIRP1Q702N8 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
XIRP1Q702N8 AC007333.1-201ENST00000568286 630 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
XIRP1Q702N8 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
XIRP1Q702N8 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
XIRP1Q702N8 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
XIRP1Q702N8 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
XIRP1Q702N8 RETN-203ENST00000629642 400 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
XIRP1Q702N8 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
XIRP1Q702N8 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
XIRP1Q702N8 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
XIRP1Q702N8 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
XIRP1Q702N8 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
XIRP1Q702N8 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
XIRP1Q702N8 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
XIRP1Q702N8 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
XIRP1Q702N8 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
XIRP1Q702N8 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
XIRP1Q702N8 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
XIRP1Q702N8 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
XIRP1Q702N8 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms