Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMY3

SPOCD1, SPOC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCD1Q6ZMY3 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SPOCD1Q6ZMY3 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SPOCD1Q6ZMY3 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SPOCD1Q6ZMY3 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SPOCD1Q6ZMY3 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SPOCD1Q6ZMY3 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SPOCD1Q6ZMY3 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SPOCD1Q6ZMY3 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SPOCD1Q6ZMY3 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SPOCD1Q6ZMY3 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SPOCD1Q6ZMY3 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SPOCD1Q6ZMY3 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SPOCD1Q6ZMY3 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SPOCD1Q6ZMY3 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SPOCD1Q6ZMY3 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SPOCD1Q6ZMY3 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SPOCD1Q6ZMY3 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SPOCD1Q6ZMY3 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SPOCD1Q6ZMY3 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SPOCD1Q6ZMY3 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SPOCD1Q6ZMY3 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SPOCD1Q6ZMY3 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
SPOCD1Q6ZMY3 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SPOCD1Q6ZMY3 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
SPOCD1Q6ZMY3 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SPOCD1Q6ZMY3 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SPOCD1Q6ZMY3 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SPOCD1Q6ZMY3 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SPOCD1Q6ZMY3 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SPOCD1Q6ZMY3 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SPOCD1Q6ZMY3 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SPOCD1Q6ZMY3 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SPOCD1Q6ZMY3 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SPOCD1Q6ZMY3 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SPOCD1Q6ZMY3 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SPOCD1Q6ZMY3 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SPOCD1Q6ZMY3 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SPOCD1Q6ZMY3 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SPOCD1Q6ZMY3 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SPOCD1Q6ZMY3 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SPOCD1Q6ZMY3 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SPOCD1Q6ZMY3 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SPOCD1Q6ZMY3 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SPOCD1Q6ZMY3 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SPOCD1Q6ZMY3 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SPOCD1Q6ZMY3 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SPOCD1Q6ZMY3 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SPOCD1Q6ZMY3 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SPOCD1Q6ZMY3 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SPOCD1Q6ZMY3 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SPOCD1Q6ZMY3 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SPOCD1Q6ZMY3 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SPOCD1Q6ZMY3 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SPOCD1Q6ZMY3 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SPOCD1Q6ZMY3 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SPOCD1Q6ZMY3 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SPOCD1Q6ZMY3 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SPOCD1Q6ZMY3 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SPOCD1Q6ZMY3 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SPOCD1Q6ZMY3 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
SPOCD1Q6ZMY3 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
SPOCD1Q6ZMY3 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SPOCD1Q6ZMY3 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
SPOCD1Q6ZMY3 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
SPOCD1Q6ZMY3 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SPOCD1Q6ZMY3 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SPOCD1Q6ZMY3 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SPOCD1Q6ZMY3 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SPOCD1Q6ZMY3 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SPOCD1Q6ZMY3 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SPOCD1Q6ZMY3 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SPOCD1Q6ZMY3 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
SPOCD1Q6ZMY3 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SPOCD1Q6ZMY3 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SPOCD1Q6ZMY3 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SPOCD1Q6ZMY3 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SPOCD1Q6ZMY3 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SPOCD1Q6ZMY3 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SPOCD1Q6ZMY3 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SPOCD1Q6ZMY3 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SPOCD1Q6ZMY3 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SPOCD1Q6ZMY3 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SPOCD1Q6ZMY3 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SPOCD1Q6ZMY3 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SPOCD1Q6ZMY3 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SPOCD1Q6ZMY3 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SPOCD1Q6ZMY3 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SPOCD1Q6ZMY3 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SPOCD1Q6ZMY3 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SPOCD1Q6ZMY3 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SPOCD1Q6ZMY3 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SPOCD1Q6ZMY3 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SPOCD1Q6ZMY3 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SPOCD1Q6ZMY3 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SPOCD1Q6ZMY3 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
SPOCD1Q6ZMY3 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SPOCD1Q6ZMY3 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
SPOCD1Q6ZMY3 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
SPOCD1Q6ZMY3 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SPOCD1Q6ZMY3 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms