Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXZ0

TMIGD1, Transmembrane and immunoglobulin domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD1Q6UXZ0 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMIGD1Q6UXZ0 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMIGD1Q6UXZ0 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMIGD1Q6UXZ0 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMIGD1Q6UXZ0 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMIGD1Q6UXZ0 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMIGD1Q6UXZ0 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMIGD1Q6UXZ0 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMIGD1Q6UXZ0 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMIGD1Q6UXZ0 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMIGD1Q6UXZ0 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMIGD1Q6UXZ0 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMIGD1Q6UXZ0 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMIGD1Q6UXZ0 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMIGD1Q6UXZ0 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMIGD1Q6UXZ0 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMIGD1Q6UXZ0 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMIGD1Q6UXZ0 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMIGD1Q6UXZ0 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMIGD1Q6UXZ0 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TMIGD1Q6UXZ0 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TMIGD1Q6UXZ0 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMIGD1Q6UXZ0 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TMIGD1Q6UXZ0 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMIGD1Q6UXZ0 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMIGD1Q6UXZ0 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMIGD1Q6UXZ0 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMIGD1Q6UXZ0 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMIGD1Q6UXZ0 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMIGD1Q6UXZ0 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMIGD1Q6UXZ0 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMIGD1Q6UXZ0 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMIGD1Q6UXZ0 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMIGD1Q6UXZ0 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMIGD1Q6UXZ0 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMIGD1Q6UXZ0 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMIGD1Q6UXZ0 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMIGD1Q6UXZ0 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMIGD1Q6UXZ0 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMIGD1Q6UXZ0 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMIGD1Q6UXZ0 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMIGD1Q6UXZ0 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMIGD1Q6UXZ0 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMIGD1Q6UXZ0 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMIGD1Q6UXZ0 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMIGD1Q6UXZ0 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMIGD1Q6UXZ0 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMIGD1Q6UXZ0 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMIGD1Q6UXZ0 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMIGD1Q6UXZ0 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMIGD1Q6UXZ0 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TMIGD1Q6UXZ0 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMIGD1Q6UXZ0 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMIGD1Q6UXZ0 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMIGD1Q6UXZ0 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TMIGD1Q6UXZ0 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMIGD1Q6UXZ0 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMIGD1Q6UXZ0 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMIGD1Q6UXZ0 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMIGD1Q6UXZ0 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMIGD1Q6UXZ0 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMIGD1Q6UXZ0 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMIGD1Q6UXZ0 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMIGD1Q6UXZ0 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMIGD1Q6UXZ0 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMIGD1Q6UXZ0 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMIGD1Q6UXZ0 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMIGD1Q6UXZ0 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMIGD1Q6UXZ0 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMIGD1Q6UXZ0 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMIGD1Q6UXZ0 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMIGD1Q6UXZ0 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMIGD1Q6UXZ0 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMIGD1Q6UXZ0 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMIGD1Q6UXZ0 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMIGD1Q6UXZ0 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMIGD1Q6UXZ0 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMIGD1Q6UXZ0 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMIGD1Q6UXZ0 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMIGD1Q6UXZ0 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMIGD1Q6UXZ0 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMIGD1Q6UXZ0 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMIGD1Q6UXZ0 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMIGD1Q6UXZ0 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMIGD1Q6UXZ0 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMIGD1Q6UXZ0 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMIGD1Q6UXZ0 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMIGD1Q6UXZ0 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMIGD1Q6UXZ0 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMIGD1Q6UXZ0 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
TMIGD1Q6UXZ0 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMIGD1Q6UXZ0 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMIGD1Q6UXZ0 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMIGD1Q6UXZ0 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMIGD1Q6UXZ0 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMIGD1Q6UXZ0 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMIGD1Q6UXZ0 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMIGD1Q6UXZ0 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMIGD1Q6UXZ0 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
TMIGD1Q6UXZ0 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms