Protein–RNA interactions for Protein: Q6R2W3

ZBED9, SCAN domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED9Q6R2W3 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZBED9Q6R2W3 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZBED9Q6R2W3 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZBED9Q6R2W3 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZBED9Q6R2W3 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZBED9Q6R2W3 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZBED9Q6R2W3 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
ZBED9Q6R2W3 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZBED9Q6R2W3 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZBED9Q6R2W3 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZBED9Q6R2W3 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZBED9Q6R2W3 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZBED9Q6R2W3 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZBED9Q6R2W3 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZBED9Q6R2W3 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZBED9Q6R2W3 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZBED9Q6R2W3 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
ZBED9Q6R2W3 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZBED9Q6R2W3 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZBED9Q6R2W3 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZBED9Q6R2W3 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZBED9Q6R2W3 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZBED9Q6R2W3 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZBED9Q6R2W3 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZBED9Q6R2W3 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZBED9Q6R2W3 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZBED9Q6R2W3 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZBED9Q6R2W3 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZBED9Q6R2W3 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZBED9Q6R2W3 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZBED9Q6R2W3 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZBED9Q6R2W3 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZBED9Q6R2W3 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZBED9Q6R2W3 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZBED9Q6R2W3 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZBED9Q6R2W3 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZBED9Q6R2W3 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
ZBED9Q6R2W3 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZBED9Q6R2W3 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZBED9Q6R2W3 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZBED9Q6R2W3 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZBED9Q6R2W3 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZBED9Q6R2W3 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZBED9Q6R2W3 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZBED9Q6R2W3 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZBED9Q6R2W3 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZBED9Q6R2W3 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZBED9Q6R2W3 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZBED9Q6R2W3 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZBED9Q6R2W3 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZBED9Q6R2W3 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZBED9Q6R2W3 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZBED9Q6R2W3 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZBED9Q6R2W3 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZBED9Q6R2W3 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZBED9Q6R2W3 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZBED9Q6R2W3 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZBED9Q6R2W3 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZBED9Q6R2W3 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZBED9Q6R2W3 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZBED9Q6R2W3 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZBED9Q6R2W3 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZBED9Q6R2W3 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
ZBED9Q6R2W3 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZBED9Q6R2W3 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZBED9Q6R2W3 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZBED9Q6R2W3 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZBED9Q6R2W3 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZBED9Q6R2W3 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
ZBED9Q6R2W3 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZBED9Q6R2W3 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZBED9Q6R2W3 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZBED9Q6R2W3 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
ZBED9Q6R2W3 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
ZBED9Q6R2W3 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZBED9Q6R2W3 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZBED9Q6R2W3 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZBED9Q6R2W3 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZBED9Q6R2W3 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZBED9Q6R2W3 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZBED9Q6R2W3 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZBED9Q6R2W3 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
ZBED9Q6R2W3 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZBED9Q6R2W3 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZBED9Q6R2W3 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZBED9Q6R2W3 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZBED9Q6R2W3 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
ZBED9Q6R2W3 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZBED9Q6R2W3 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZBED9Q6R2W3 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZBED9Q6R2W3 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZBED9Q6R2W3 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZBED9Q6R2W3 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZBED9Q6R2W3 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZBED9Q6R2W3 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
ZBED9Q6R2W3 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZBED9Q6R2W3 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
ZBED9Q6R2W3 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZBED9Q6R2W3 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZBED9Q6R2W3 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72 ms