Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXT2

H3F3C, Histone H3.3C, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3F3CQ6NXT2 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
H3F3CQ6NXT2 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
H3F3CQ6NXT2 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
H3F3CQ6NXT2 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
H3F3CQ6NXT2 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
H3F3CQ6NXT2 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
H3F3CQ6NXT2 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
H3F3CQ6NXT2 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
H3F3CQ6NXT2 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
H3F3CQ6NXT2 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
H3F3CQ6NXT2 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
H3F3CQ6NXT2 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
H3F3CQ6NXT2 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
H3F3CQ6NXT2 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
H3F3CQ6NXT2 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
H3F3CQ6NXT2 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
H3F3CQ6NXT2 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
H3F3CQ6NXT2 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
H3F3CQ6NXT2 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
H3F3CQ6NXT2 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
H3F3CQ6NXT2 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
H3F3CQ6NXT2 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
H3F3CQ6NXT2 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
H3F3CQ6NXT2 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
H3F3CQ6NXT2 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
H3F3CQ6NXT2 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
H3F3CQ6NXT2 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
H3F3CQ6NXT2 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
H3F3CQ6NXT2 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
H3F3CQ6NXT2 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
H3F3CQ6NXT2 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
H3F3CQ6NXT2 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
H3F3CQ6NXT2 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
H3F3CQ6NXT2 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
H3F3CQ6NXT2 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
H3F3CQ6NXT2 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
H3F3CQ6NXT2 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
H3F3CQ6NXT2 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
H3F3CQ6NXT2 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
H3F3CQ6NXT2 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
H3F3CQ6NXT2 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
H3F3CQ6NXT2 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
H3F3CQ6NXT2 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
H3F3CQ6NXT2 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
H3F3CQ6NXT2 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
H3F3CQ6NXT2 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
H3F3CQ6NXT2 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
H3F3CQ6NXT2 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
H3F3CQ6NXT2 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
H3F3CQ6NXT2 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
H3F3CQ6NXT2 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
H3F3CQ6NXT2 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
H3F3CQ6NXT2 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
H3F3CQ6NXT2 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
H3F3CQ6NXT2 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
H3F3CQ6NXT2 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
H3F3CQ6NXT2 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
H3F3CQ6NXT2 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
H3F3CQ6NXT2 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
H3F3CQ6NXT2 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
H3F3CQ6NXT2 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
H3F3CQ6NXT2 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
H3F3CQ6NXT2 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
H3F3CQ6NXT2 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
H3F3CQ6NXT2 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
H3F3CQ6NXT2 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
H3F3CQ6NXT2 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
H3F3CQ6NXT2 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
H3F3CQ6NXT2 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
H3F3CQ6NXT2 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
H3F3CQ6NXT2 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
H3F3CQ6NXT2 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
H3F3CQ6NXT2 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
H3F3CQ6NXT2 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
H3F3CQ6NXT2 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
H3F3CQ6NXT2 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
H3F3CQ6NXT2 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
H3F3CQ6NXT2 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
H3F3CQ6NXT2 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
H3F3CQ6NXT2 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
H3F3CQ6NXT2 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
H3F3CQ6NXT2 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
H3F3CQ6NXT2 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
H3F3CQ6NXT2 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
H3F3CQ6NXT2 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
H3F3CQ6NXT2 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
H3F3CQ6NXT2 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
H3F3CQ6NXT2 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
H3F3CQ6NXT2 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
H3F3CQ6NXT2 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
H3F3CQ6NXT2 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
H3F3CQ6NXT2 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
H3F3CQ6NXT2 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
H3F3CQ6NXT2 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
H3F3CQ6NXT2 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
H3F3CQ6NXT2 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
H3F3CQ6NXT2 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
H3F3CQ6NXT2 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
H3F3CQ6NXT2 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
H3F3CQ6NXT2 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms