Protein–RNA interactions for Protein: Q6AI12

ANKRD40, Ankyrin repeat domain-containing protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD40Q6AI12 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
ANKRD40Q6AI12 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.59
ANKRD40Q6AI12 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ANKRD40Q6AI12 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ANKRD40Q6AI12 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ANKRD40Q6AI12 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ANKRD40Q6AI12 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ANKRD40Q6AI12 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ANKRD40Q6AI12 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ANKRD40Q6AI12 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ANKRD40Q6AI12 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ANKRD40Q6AI12 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ANKRD40Q6AI12 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ANKRD40Q6AI12 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ANKRD40Q6AI12 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ANKRD40Q6AI12 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ANKRD40Q6AI12 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ANKRD40Q6AI12 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
ANKRD40Q6AI12 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ANKRD40Q6AI12 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ANKRD40Q6AI12 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ANKRD40Q6AI12 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ANKRD40Q6AI12 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
ANKRD40Q6AI12 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ANKRD40Q6AI12 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ANKRD40Q6AI12 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ANKRD40Q6AI12 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ANKRD40Q6AI12 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ANKRD40Q6AI12 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
ANKRD40Q6AI12 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ANKRD40Q6AI12 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ANKRD40Q6AI12 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ANKRD40Q6AI12 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ANKRD40Q6AI12 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ANKRD40Q6AI12 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ANKRD40Q6AI12 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ANKRD40Q6AI12 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ANKRD40Q6AI12 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
ANKRD40Q6AI12 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ANKRD40Q6AI12 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ANKRD40Q6AI12 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ANKRD40Q6AI12 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ANKRD40Q6AI12 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ANKRD40Q6AI12 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ANKRD40Q6AI12 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ANKRD40Q6AI12 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ANKRD40Q6AI12 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ANKRD40Q6AI12 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ANKRD40Q6AI12 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ANKRD40Q6AI12 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ANKRD40Q6AI12 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ANKRD40Q6AI12 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ANKRD40Q6AI12 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
ANKRD40Q6AI12 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ANKRD40Q6AI12 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ANKRD40Q6AI12 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
ANKRD40Q6AI12 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ANKRD40Q6AI12 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
ANKRD40Q6AI12 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ANKRD40Q6AI12 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
ANKRD40Q6AI12 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ANKRD40Q6AI12 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ANKRD40Q6AI12 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ANKRD40Q6AI12 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ANKRD40Q6AI12 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ANKRD40Q6AI12 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ANKRD40Q6AI12 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ANKRD40Q6AI12 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ANKRD40Q6AI12 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ANKRD40Q6AI12 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ANKRD40Q6AI12 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ANKRD40Q6AI12 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ANKRD40Q6AI12 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ANKRD40Q6AI12 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
ANKRD40Q6AI12 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
ANKRD40Q6AI12 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ANKRD40Q6AI12 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ANKRD40Q6AI12 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ANKRD40Q6AI12 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ANKRD40Q6AI12 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ANKRD40Q6AI12 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ANKRD40Q6AI12 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ANKRD40Q6AI12 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ANKRD40Q6AI12 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ANKRD40Q6AI12 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ANKRD40Q6AI12 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ANKRD40Q6AI12 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ANKRD40Q6AI12 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ANKRD40Q6AI12 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ANKRD40Q6AI12 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ANKRD40Q6AI12 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ANKRD40Q6AI12 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ANKRD40Q6AI12 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ANKRD40Q6AI12 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ANKRD40Q6AI12 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ANKRD40Q6AI12 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ANKRD40Q6AI12 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ANKRD40Q6AI12 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ANKRD40Q6AI12 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ANKRD40Q6AI12 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms